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2020年的世界,是人類社會對抗病毒生物的世界,計算生物學(xué)研究成為疫苗研制、新藥研發(fā)的新突破口。近期,百度飛槳上線了10萬獎池生物計算大賽:螺旋槳RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽:Unpaired Probability Prediction。比賽不僅聚焦AI戰(zhàn)疫的真實技術(shù)難點,更得到了世界知名計算生物學(xué)專家David H. Mathews和北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授劉君的大力支持與指導(dǎo)。
【賽題任務(wù)】該賽題旨在解決RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測問題,要求參賽選手基于百度發(fā)布的2個世界上最快的算法:RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測算法LinearFold和 RNA配分方程算法LinearPartition,預(yù)測給定RNA序列在每個位點上保持不成對的概率。
然鵝,我聽到的卻是這樣的聲音:
A同學(xué):RNA啊,我似乎好像大概在多年前的中學(xué)生物課堂上聽到過。
B同學(xué):作為一個術(shù)業(yè)有專攻的IT人才,我的全部精力只奉獻給了計算機科學(xué)......
C同學(xué):結(jié)構(gòu)預(yù)測聽起來太高大上,你們玩,我先撤了!

英雄請留步!
百度飛槳開發(fā)者技術(shù)專家、百度大腦智能對話訓(xùn)練師為大家總結(jié)了超詳細的參賽知識點,理解賽題so easy!
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世界頂級算法支持,學(xué)習(xí)資料一鍵獲取
2019年,百度研究院發(fā)布了世界上最快的RNA二級結(jié)構(gòu)算法LinearFold,該算法可將新冠病毒全基因組序列結(jié)構(gòu)預(yù)測時間從55分鐘降低到27秒。2020年,百度研究院又發(fā)布了世界上最快的RNA配分方程算法LinearPartition,通過它可以更準確的描述RNA結(jié)構(gòu)分布。有了這兩大世界頂級算法助陣,RNA結(jié)構(gòu)的預(yù)測速度與預(yù)測精度得到了前所未有的提高,為疫情分析及疫苗研制提供了極大支持。如何在LinearFold和LinearPartition的基礎(chǔ)上進一步提高RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測速度與精度,將有助于我們更深入的了解RNA病毒,開發(fā)出相應(yīng)的檢測手段和治療藥物,因而成為全世界科學(xué)家持續(xù)探索的重要課題。

本次比賽百度研究院也為大家總結(jié)了大量干貨資料。掃上方二維碼報名即可get資料鏈接。
百度飛槳官方提供的RNA二級結(jié)構(gòu)講義:
RNA secondary structure prediction and analysis
RNA Secondary Structure Prediction
中國大學(xué)MOOC上武漢大學(xué)的分子生物學(xué)課程:
Molecular Biology
知網(wǎng)學(xué)術(shù)論文:
RNA二級結(jié)構(gòu)點括號圖與CT文件表示法的相互轉(zhuǎn)換算法研究
基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法研究
前沿賽題緊跟時代,獨家數(shù)據(jù)先睹為快
大分子結(jié)構(gòu)預(yù)測是計算生物學(xué)領(lǐng)域非常前沿的研究方向,吸引著全世界頂級研究者的關(guān)注。今年DeepMind AlphaFold 2在CASP14蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽上利用AI技術(shù)大大提升了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的精度和效率,預(yù)示著AI技術(shù)將在計算生物學(xué)領(lǐng)域迎來大爆發(fā)。與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測相似,RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測同樣是一個非常重要且前沿的研究領(lǐng)域,也是AI技術(shù)能夠大展身手的應(yīng)用方向。
本次比賽分為A榜和B榜兩個階段,B榜數(shù)據(jù)集中的所有數(shù)據(jù)均為獨家保密數(shù)據(jù),將由RNA結(jié)構(gòu)實驗輔助得來。該實驗會與比賽同期進行,極大的保證了測試集數(shù)據(jù)的真實性與公正性。

資深專家親自指導(dǎo),賽題理解一步到位
本次比賽誠邀世界知名計算生物學(xué)專家、羅徹斯特大學(xué)RNA研究中心主任、生物化學(xué)和生物物理系David H. Mathews教授作為RNA生物計算指導(dǎo)專家;還有幸邀請到北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院劉君教授作為實驗驗證指導(dǎo)專家。

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抗議征程還未到終點,生命科學(xué)探索和醫(yī)藥技術(shù)創(chuàng)新仍舊任重道遠。站在AI新時代的技術(shù)前沿,我們誠邀您參加本次比賽,用您的熱情與行動彰顯當(dāng)代技術(shù)人的責(zé)任與擔(dān)當(dāng)!
