輕輕松松畫個熱圖
熱圖是很常見的圖形展示方式，在?圖形解讀系列 | 給你5個示例，你能看懂常用熱圖使用嗎？有詳細(xì)描述。熱圖基本原則是用顏色代表數(shù)字，讓數(shù)據(jù)呈現(xiàn)更直觀、對比更明顯。常用來表示不同樣品組代表性基因的表達(dá)差異、不同樣品組代表性化合物的含量差異、不同樣品之間的兩兩相似性。實際上，任何一個表格數(shù)據(jù)都可以轉(zhuǎn)換為熱圖展示。
熱圖通過將數(shù)據(jù)矩陣中的各個值按一定規(guī)律映射為顏色展示，利用顏色變化來可視化比較數(shù)據(jù)。當(dāng)應(yīng)用于數(shù)值矩陣時，熱圖中每個單元格的顏色展示的是行變量和列變量交叉處的數(shù)據(jù)值的大小；若行為基因，列為樣品，則是對應(yīng)基因在對應(yīng)樣品的表達(dá)值；若行和列都為樣品，展示的可能是對應(yīng)的兩個樣品之間的相關(guān)性。
注意：正因為熱圖應(yīng)用如此之廣，又可以表示很多種不同類型數(shù)據(jù)。解讀熱圖時不要先入為主，直接就給其定性為表達(dá)熱圖、相關(guān)性熱圖；而是要想看圖例、橫軸、縱軸，結(jié)合圖形標(biāo)題一起解讀。
基因表達(dá)熱圖繪制
使用的繪圖數(shù)據(jù)是DESeq2標(biāo)準(zhǔn)化后的表達(dá)矩陣 ehbio.simplier.DESeq2.normalized.rlog.xls。
截取前15行粘貼進(jìn)入熱圖 (http://www.ehbio.com/Cloud_Platform/front/#/analysis?page=b%27Ng%3D%3D%27)繪制的文本域：
每一行是一個基因，每一列是一個樣品。
點擊Check data確認(rèn)數(shù)據(jù)無誤，點擊Submit就可以出圖了。
普普通通一張熱圖，橫坐標(biāo)重疊一起了，需要調(diào)整下，Layout面板下的X-axis ticks rotation angle設(shè)置為45度；
再次出圖
最左邊的樣本名字沒有顯示完整，調(diào)整下圖形的寬和高
提交后獲得結(jié)果
后面再演示聚類等更多操作
測試數(shù)據(jù)獲取：https://gitee.com/ct5869/bic
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