恭喜易生信的朋友再發(fā)Nature
2020年1月16日， Nature上在線發(fā)表題為“Decoding the ?development of the human ?hippocampus”的研究論文。該工作系統(tǒng)闡明了人海馬體胚胎發(fā)育過程中的基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細胞命決定因子，繪制了高精度發(fā)育細胞圖譜，解析了海馬發(fā)育過程中的不同細胞類型及其關(guān)鍵的分子與調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
海馬體，是由端腦的內(nèi)側(cè)區(qū)域發(fā)育而來，是大腦中一個至關(guān)重要的特殊結(jié)構(gòu)。海馬體是邊緣系統(tǒng)的一部分，在信息編碼、短時記憶、長時記憶、空間導航等方面發(fā)揮著重要作用，另外，海馬體和癲癇、智力障礙、阿爾茨海默病等多種病理的發(fā)病機制密切相關(guān)，引起了臨床醫(yī)生和神經(jīng)科學家的廣泛關(guān)注。在阿爾茨海默氏癥中，海馬體是最先受到影響的大腦區(qū)域之一，早期癥狀包括記憶力喪失和定向障礙。海馬體的發(fā)育對于我們深入研究記憶功能的形成的細胞和分子機制有著不可替代的必要性，雖然海馬體是脊椎動物大腦中一個進化上保守的器官，但對發(fā)育中的人類海馬體的細胞和分子特征仍缺乏了解。
在該研究中，研究人員首次通過高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)對人類胚胎期16周到27周海馬體關(guān)鍵發(fā)育期的30416個單細胞進行了測序，并利用了經(jīng)典的tSNE分析把細胞劃分為8大類，47個不同的細胞亞型。并對其中關(guān)鍵的神經(jīng)干細胞的動態(tài)發(fā)育進行系統(tǒng)的功能研究，深入闡明人腦海馬在動態(tài)變化的發(fā)育過程以及記憶功能環(huán)路的形成的細胞基礎(chǔ)和分子機制。同時，該研究結(jié)合跨物種平臺，多角度比較在海馬的進化過程中，人類與嚙齒類動物海馬的關(guān)鍵差異，全方位多層次地揭示海馬發(fā)育的重要關(guān)鍵時間節(jié)點以及關(guān)鍵基因，為相關(guān)疾病臨床應(yīng)用和治療提供有力的前期基礎(chǔ)。
圖. 人海馬胚胎發(fā)育的動態(tài)路徑與調(diào)控關(guān)鍵分子
以上工作由中國科學院生物物理研究所、北京師范大學和北京大學合作完成。中國科學院生物物理研究所王曉群研究員和北京師范大學吳倩教授同為本文的共同通訊作者，中國科學院生物物理所的研究人員鐘穗娟博士、孫樂副研究員、博士生盧玉峰和北京師范大學的丁文玉博士為本文共同第一作者。本研究得到科技部973項目，中科院先導專項、國家自然科學基金等項目的資助。
文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41586-019-1917-5
來源：http://www.ibp.cas.cn/kyjz/zxdt/20200/t20200117_5489044.html
Hemberg-lab單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析（三）- 原始數(shù)據(jù)質(zhì)控
Hemberg-lab單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析（七）- 導入10X和SmartSeq2數(shù)據(jù)Tabula Muris
Hemberg-lab單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析（十一）- Scater單細胞表達譜PCA可視化
Hemberg-lab單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析（十二）- Scater單細胞表達譜tSNE可視化
高顏值免費在線繪圖
往期精品
心得體會?TCGA數(shù)據(jù)庫?Linux?Python?
后臺回復“生信寶典福利第一波”或點擊閱讀原文獲取教程合集