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說到 GitHub 就不得不提 Git，它的誕生也頗具傳奇色彩。

在1991年，大佬 Linus 構(gòu)建了開源操作系統(tǒng)，并命名為 Linux，隨后帶領(lǐng)全世界計算機(jī)愛好者逐漸完善該系統(tǒng) 。

相對我們熟悉的Windows系統(tǒng)，這個名叫 Linux 的操作系統(tǒng)同樣滲透到我們生活的方方面面，比如是大部分網(wǎng)站應(yīng)用數(shù)據(jù)與服務(wù)的系統(tǒng)載體。包括手機(jī)的 Android 系統(tǒng)，車載系統(tǒng)，智能終端等等也是基于 Linux 內(nèi)核完成。

Linux 在開發(fā)伊始，Linux 開源社區(qū)的人們通過將源代碼文件通過 diff 的方式發(fā)送給 Linus 大佬，然后 Linus 使用多年的功力手工將這些代碼整合到 Linus。但是，隨著社區(qū)提供的代碼越來越多，Linus 也頂不住了。

這時候，就需要一款工具可以將不同人，不同來源的代碼整合到軟件的主代碼中。而且可以對源代碼修改，刪除等等改動一一記錄，方便后續(xù)的調(diào)試和整合。

這樣做既可以提高工作效率，方便調(diào)試，同時也避免了人為錯誤導(dǎo)致軟件的不穩(wěn)定?？傊?，這款工具的使用對 Linux 的發(fā)展必不可少。

及時雨來自商業(yè)版本控制系統(tǒng) BitKeeper，它向 Linus 拋出了橄欖枝，允許 Linux 開發(fā)社區(qū)免費使用。但是，問題在于社區(qū)里都是計算機(jī)技術(shù)狂熱者，這相當(dāng)于給了餓了幾天的人一個包子，說你不能吃肉餡，只能吃皮。

于是，有人對這個控制系統(tǒng)產(chǎn)生了想法，Samba（Linux的文件共享和打印機(jī)通信協(xié)議）的開發(fā)者 Andrew 開始嘗試破解 BitKeeper，嘗嘗肉餡是什么味。

好景不長，BitKeeper 的開發(fā)公司 BitMover 發(fā)現(xiàn)了社區(qū)有人在破解他們的軟件，而且還不止 Andrew 一人，于是公司看透了這群「綠林好漢}，在2005年 BitKeeper 收回了 Linux 社區(qū)的免費使用權(quán)。

沒有了免費的版本控制系統(tǒng)，日子還得過，Linux 的代碼量還在與日俱增，Linux 社區(qū)要給商業(yè)軟件低頭了嗎？

事實是，并沒有。

2005 年，Linus 為了解決這一問題，他自己花了兩周時間開發(fā)了一個分布式版本控制系統(tǒng) Git，你沒有看錯是兩周時間，大佬的世界我不懂。

一個月后，Git 完成 Linux 系統(tǒng)源碼接管任務(wù)，隨后 Git 迅速在開源社區(qū)間流行。

GitHub 的出生

Git 可以在本地執(zhí)行，但是這只是你一個人在玩代碼。如果你想通過 Git 分享你的代碼或者與其他開發(fā)人員合作。你就需要將數(shù)據(jù)放到一臺其他開發(fā)人員能夠連接的服務(wù)器上。

2008年， GitHub 應(yīng)運而生，它為每個人提供了遠(yuǎn)程倉庫，并且提供了相應(yīng)的社區(qū)化服務(wù)。

GitHub的上線為開源項目提供了立足之地，我們熟系的 JQuery，PHP 等開源項目開始從獨立的社區(qū)遷移到 GitHub。而正如 Apache 開源基金會所提倡的先社區(qū)而后代碼，一個強(qiáng)有力的社區(qū)能使一款有潛力的軟件持續(xù)的向好發(fā)展。

其實，我們現(xiàn)在看生信文獻(xiàn)的時候，只有涉及到生信軟件發(fā)布，數(shù)據(jù)流程處理，在線軟件等等與編程相關(guān)的上線項目都會首先發(fā)布在GitHub，并提供 GitHub 克隆地址。

2018年，微軟宣布以 75 億美元收購 GitHub。

2019年，GitHub 宣布開發(fā)者可以免費最多四人協(xié)作的私人倉庫。這一權(quán)限的開放，使得我們大部分的實驗人員都可以更好的加入 GitHub 社區(qū)，完成多人協(xié)作任務(wù)。

歷史的拐點就是這么神奇，如果沒有 Andrew 的破解，BitKeeper的憤怒，Linus 也不會創(chuàng)造出 Git，也更不會有現(xiàn)在免費的 GitHub。

GitHub 和 Git 對我們來說有什么用？

從上面的故事可以看出，Git 和 GitHub 要解決的是多人協(xié)作完成不同地點，不同時間提交源碼并整合到最終項目的問題?？偨Y(jié)下：

版本管理：通過使用快照等方式，可以將你的代碼修改可以提交到 Git 庫。只要提交，全部的數(shù)據(jù)就會被記錄一個版本，而且Git很難執(zhí)行不可逆操作，這就意味著只要提交，數(shù)據(jù)想丟都難。

協(xié)同修改：多人并行不悖的修改服務(wù)器端的同一個文件，數(shù)據(jù)備份。

文件狀態(tài)：不僅保存目錄和文件的當(dāng)前狀態(tài)，還能夠保存每一個提交過的歷史狀態(tài)，很贊的功能就是，可以將歷史代碼回溯到某個時間點的狀態(tài)。

權(quán)限控制：團(tuán)隊中每個人對文件具有不同權(quán)限，也可以接受非團(tuán)隊合并源碼。

分支管理：將不同來源，功能整合與主要代碼中，允許開發(fā)團(tuán)隊在工作過程中多條生產(chǎn)線同時推進(jìn)任務(wù)，進(jìn)一步提高效率。

分布式：同一個 Git 倉庫，可以分布到不同的機(jī)器上，這就意味著代碼可以在云端和本地都有一套完整的倉庫，除了離線使用的便利，提高了執(zhí)行速度，多個拷貝也提高了數(shù)據(jù)安全性。

剛剛介紹了 GitHub 和 Git 的誕生歷史，接下來是有用的小技巧。我們平常 coding 都是在 IDE 中，比如 Intellij IDEA、Pycharm，如何如果能把 Git 和 GitHub 植入到 IDE 中，很多事會方便很多。接下來我們完成 Git，GitHub 在 IDE 中的安裝，以 Pycharm 為例， IDEA 也是 Jetbrain 旗下產(chǎn)品，配置方式也大同小異。：

安裝 Git

CentOS

sudo yum install git-all
git --version

Ubuntu

sudo apt-get install git

Windows

下載地址：https://git-scm.com/downloads

本地 Git 關(guān)聯(lián) GitHub 遠(yuǎn)程倉庫

如果你先安裝了Git環(huán)境，請啪啪啪搞出下面這個命令就差不多了。

配置用戶名

git config --global user.name "guangguang"

配置郵箱

git config --global user.email "[email protected]"

其他配置

git config --global merge.tool "kdiff3"

git config --global core.autocrlf false // Git不用管換行符的事情

編碼配置

git config --global gui.encoding utf-8 //gui中的中文亂碼

git config --global core.quotePath off //避免status顯示中文亂碼

Windows上還需要配置

git config --global core.ignorecase false

Git SSH key

Git Bash鍵入如下的命令

ssh-keygen -t rsa -C "1027700603@qq.com"

然后一路回車，不要輸入人么密碼，就會生產(chǎn) ssh key pair
鍵入以下命令，~/ 指的是用戶目錄下

ssh-add ~/.ssh/id_rsa

// 如果執(zhí)行ssh-add時出現(xiàn)Could not open a connection to your authentication agent執(zhí)行ssh-add ~/.ssh/id_rsa報標(biāo)題之前像執(zhí)行 eval `ssh-agent` (~鍵上的`)，再執(zhí)行ssh-add ~/.ssh/id_rsa成功ssh-add -l就有新加的rsa了

cat ~/.ssh/id_rsa.pub

把生產(chǎn)的文明編碼進(jìn)行復(fù)制，需要放到自己的 GitHub 中的 SSH 中

2. 進(jìn)入GitHub ，打開設(shè)置

3.新建一個 SSH key

4. 填寫 SSH key

5. 新建 GitHub 倉庫

6. 填寫信息，創(chuàng)建 GitHub 倉庫

7. 完成后你的倉庫后，類似這樣，紅框為 git 地址

8. 將 GitHub 倉庫與我們本地的 Git 倉庫進(jìn)行關(guān)聯(lián)

git remote add origin https://github.com/qqdb/example01.git

origin 后的 url 就是 GitHub 倉庫地址，在上一步中獲取

9. 將本地 Git 倉庫提交到 GitHub 遠(yuǎn)程倉庫

第一次提交：

git push -u origin master

之后提交

git push origin master

如果報錯：

解決：

git push -f origin master

這是一種強(qiáng)制上傳方案，第一次可以使用，今后不建議使用。因為這條命令會直接覆蓋遠(yuǎn)程倉庫的版本信息。

推送本地倉庫到 GitHub

1. 進(jìn)入設(shè)置

2. 登錄 GitHub 賬號

3. 配置 Git

4. 使用

5. 配置

6. 上傳，這里一般會全部上傳到 GitHub，如果有大文件可以考慮取消勾選。

7. 上傳成功

將 GitHub 倉庫克隆到本地

1. 進(jìn)入配置

2.克隆項目。

克隆大佬的項目

完成后會有讀條

3. 從 Pycharm 中查看 Github

4.一般的 Git 操作

參與 GitHub 項目

1. Fork 一個項目

Fork 是 GitHub 存儲庫的副本，可在不影響原始項目的情況下更改代碼。

比如，https://github.com/scikit-learn/scikit-learn

2. 進(jìn)入 Pycharm 的版本控制界面

3. 克隆大佬項目

等進(jìn)度條跑完

我們會得到項目的倉庫

4.查看項目參與者的操作日志

5. 項目參與者創(chuàng)建pull請求

填寫pull請求

項目的維護(hù)者管理 pull 請求

查看pull請求信息

本文來源：

[1] 整理補(bǔ)充：逛逛GitHub (公眾號@ggGitHub)

[2] www.jinshuin.proginn.com/p/763bfbd378e2


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