circosPerl可視化圖形軟件包
Circos 是一個Perl語言開發(fā)的自由可視化軟件,使用GPL協議分發(fā),以繪制輸出圈圖(原型風格的圖)為最大特色;最初主要用于基因組序列相關數據的可視化,目前已應用于多個領域,例如 影視作品中的人物關系分析,物流公司的訂單來源和流向分析等,大多數關系型數據都可以嘗試用 circos來可視化。
Circos 是由加拿大的一位生物信息科學家 Martin Krzywinski 所開發(fā),他同時是一位專業(yè)攝影師,最初他主要從事Linux系統(tǒng)管理等工作。Circos 使用Perl語言開發(fā),所以可以安裝在任何支持Perl的操作系統(tǒng)上如linux, mac os, windows 等;Circos 主要使用Perl的GD庫來繪圖,可輸出PNG位圖或SVG矢量圖;Circos采用文本配置文件的方式來指定輸入輸出文件以及圖形樣式和繪圖規(guī)則等。
Circos 英文的mail list 在 http://groups.google.com/group/circos-data-visualization,同時中文社區(qū)也很活躍,參考 http://code.google.com/p/circos-chn ,此處有一部分Circos中文相關的資料,同時有社區(qū)成員修改的circos版本供下載使用,以方便安裝和入門。
Circos 案例:
基因組數據的可視化
Linux內核發(fā)展的可視化
影視作品人物關系的可視化
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