加速 PyTorch 模型訓(xùn)練的 9 個(gè)技巧
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重磅干貨,第一時(shí)間送達(dá)
一個(gè)step by step的指南,非常的實(shí)用。

讓我們面對(duì)現(xiàn)實(shí)吧,你的模型可能還停留在石器時(shí)代。我敢打賭你仍然使用32位精度或GASP甚至只在一個(gè)GPU上訓(xùn)練。
我明白,網(wǎng)上都是各種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)加速指南,但是一個(gè)checklist都沒(méi)有(現(xiàn)在有了),使用這個(gè)清單,一步一步確保你能榨干你模型的所有性能。
本指南從最簡(jiǎn)單的結(jié)構(gòu)到最復(fù)雜的改動(dòng)都有,可以使你的網(wǎng)絡(luò)得到最大的好處。我會(huì)給你展示示例Pytorch代碼以及可以在Pytorch- lightning Trainer中使用的相關(guān)flags,這樣你可以不用自己編寫(xiě)這些代碼!
**這本指南是為誰(shuí)準(zhǔn)備的?**任何使用Pytorch進(jìn)行深度學(xué)習(xí)模型研究的人,如研究人員、博士生、學(xué)者等,我們?cè)谶@里談?wù)摰哪P涂赡苄枰慊ㄙM(fèi)幾天的訓(xùn)練,甚至是幾周或幾個(gè)月。
我們會(huì)講到:
使用DataLoaders DataLoader中的workers數(shù)量 Batch size 梯度累計(jì) 保留的計(jì)算圖 移動(dòng)到單個(gè) 16-bit 混合精度訓(xùn)練 移動(dòng)到多個(gè)GPUs中(模型復(fù)制) 移動(dòng)到多個(gè)GPU-nodes中 (8+GPUs) 思考模型加速的技巧
Pytorch-Lightning

你可以在Pytorch的庫(kù)Pytorch- lightning中找到我在這里討論的每一個(gè)優(yōu)化。Lightning是在Pytorch之上的一個(gè)封裝,它可以自動(dòng)訓(xùn)練,同時(shí)讓研究人員完全控制關(guān)鍵的模型組件。Lightning 使用最新的最佳實(shí)踐,并將你可能出錯(cuò)的地方最小化。
我們?yōu)镸NIST定義LightningModel并使用Trainer來(lái)訓(xùn)練模型。
from?pytorch_lightning?import?Trainer
model?=?LightningModule(…)
trainer?=?Trainer()
trainer.fit(model)

這可能是最容易獲得速度增益的地方。保存h5py或numpy文件以加速數(shù)據(jù)加載的時(shí)代已經(jīng)一去不復(fù)返了,使用Pytorch dataloader加載圖像數(shù)據(jù)很簡(jiǎn)單(對(duì)于NLP數(shù)據(jù),請(qǐng)查看TorchText)。
在lightning中,你不需要指定訓(xùn)練循環(huán),只需要定義dataLoaders和Trainer就會(huì)在需要的時(shí)候調(diào)用它們。
dataset?=?MNIST(root=self.hparams.data_root,?train=train,?download=True)
loader?=?DataLoader(dataset,?batch_size=32,?shuffle=True)
for?batch?in?loader:
??x,?y?=?batch
??model.training_step(x,?y)
??...

另一個(gè)加速的神奇之處是允許批量并行加載。因此,您可以一次裝載nb_workers個(gè)batch,而不是一次裝載一個(gè)batch。
#?slow
loader?=?DataLoader(dataset,?batch_size=32,?shuffle=True)
#?fast?(use?10?workers)
loader?=?DataLoader(dataset,?batch_size=32,?shuffle=True,?num_workers=10)

在開(kāi)始下一個(gè)優(yōu)化步驟之前,將batch size增大到CPU-RAM或GPU-RAM所允許的最大范圍。
下一節(jié)將重點(diǎn)介紹如何幫助減少內(nèi)存占用,以便你可以繼續(xù)增加batch size。
記住,你可能需要再次更新你的學(xué)習(xí)率。一個(gè)好的經(jīng)驗(yàn)法則是,如果batch size加倍,那么學(xué)習(xí)率就加倍。

在你已經(jīng)達(dá)到計(jì)算資源上限的情況下,你的batch size仍然太小(比如8),然后我們需要模擬一個(gè)更大的batch size來(lái)進(jìn)行梯度下降,以提供一個(gè)良好的估計(jì)。
假設(shè)我們想要達(dá)到128的batch size大小。我們需要以batch size為8執(zhí)行16個(gè)前向傳播和向后傳播,然后再執(zhí)行一次優(yōu)化步驟。
#?clear?last?step
optimizer.zero_grad()
#?16?accumulated?gradient?steps
scaled_loss?=?0
for?accumulated_step_i?in?range(16):
?????out?=?model.forward()
?????loss?=?some_loss(out,y)????
?????loss.backward()
??????scaled_loss?+=?loss.item()
??????
#?update?weights?after?8?steps.?effective?batch?=?8*16
optimizer.step()
#?loss?is?now?scaled?up?by?the?number?of?accumulated?batches
actual_loss?=?scaled_loss?/?16
在lightning中,全部都給你做好了,只需要設(shè)置accumulate_grad_batches=16:
trainer?=?Trainer(accumulate_grad_batches=16)
trainer.fit(model)

一個(gè)最簡(jiǎn)單撐爆你的內(nèi)存的方法是為了記錄日志存儲(chǔ)你的loss。
losses?=?[]
...
losses.append(loss)
print(f'current?loss:?{torch.mean(losses)'})
上面的問(wèn)題是,loss仍然包含有整個(gè)圖的副本。在這種情況下,調(diào)用.item()來(lái)釋放它。
#?bad
losses.append(loss)
#?good
losses.append(loss.item())
Lightning會(huì)非常小心,確保不會(huì)保留計(jì)算圖的副本。

一旦你已經(jīng)完成了前面的步驟,是時(shí)候進(jìn)入GPU訓(xùn)練了。在GPU上的訓(xùn)練將使多個(gè)GPU cores之間的數(shù)學(xué)計(jì)算并行化。你得到的加速取決于你所使用的GPU類(lèi)型。我推薦個(gè)人用2080Ti,公司用V100。
乍一看,這可能會(huì)讓你不知所措,但你真的只需要做兩件事:1)移動(dòng)你的模型到GPU, 2)每當(dāng)你運(yùn)行數(shù)據(jù)通過(guò)它,把數(shù)據(jù)放到GPU上。
#?put?model?on?GPU
model.cuda(0)
#?put?data?on?gpu?(cuda?on?a?variable?returns?a?cuda?copy)
x?=?x.cuda(0)
#?runs?on?GPU?now
model(x)
如果你使用Lightning,你什么都不用做,只需要設(shè)置Trainer(gpus=1)。
#?ask?lightning?to?use?gpu?0?for?training
trainer?=?Trainer(gpus=[0])
trainer.fit(model)
在GPU上進(jìn)行訓(xùn)練時(shí),要注意的主要事情是限制CPU和GPU之間的傳輸次數(shù)。
#?expensive
x?=?x.cuda(0)#?very?expensive
x?=?x.cpu()
x?=?x.cuda(0)
如果內(nèi)存耗盡,不要將數(shù)據(jù)移回CPU以節(jié)省內(nèi)存。在求助于GPU之前,嘗試以其他方式優(yōu)化你的代碼或GPU之間的內(nèi)存分布。
另一件需要注意的事情是調(diào)用強(qiáng)制GPU同步的操作。清除內(nèi)存緩存就是一個(gè)例子。
#?really?bad?idea.?Stops?all?the?GPUs?until?they?all?catch?up
torch.cuda.empty_cache()
但是,如果使用Lightning,惟一可能出現(xiàn)問(wèn)題的地方是在定義Lightning Module時(shí)。Lightning會(huì)特別注意不去犯這類(lèi)錯(cuò)誤。
16bit精度是將內(nèi)存占用減半的驚人技術(shù)。大多數(shù)模型使用32bit精度數(shù)字進(jìn)行訓(xùn)練。然而,最近的研究發(fā)現(xiàn),16bit模型也可以工作得很好。混合精度意味著對(duì)某些內(nèi)容使用16bit,但將權(quán)重等內(nèi)容保持在32bit。
要在Pytorch中使用16bit精度,請(qǐng)安裝NVIDIA的apex庫(kù),并對(duì)你的模型進(jìn)行這些更改。
#?enable?16-bit?on?the?model?and?the?optimizer
model,?optimizers?=?amp.initialize(model,?optimizers,?opt_level='O2')
#?when?doing?.backward,?let?amp?do?it?so?it?can?scale?the?loss
with?amp.scale_loss(loss,?optimizer)?as?scaled_loss:??????????????????????
????scaled_loss.backward()
amp包會(huì)處理好大部分事情。如果梯度爆炸或趨向于0,它甚至?xí)s放loss。
在lightning中,啟用16bit并不需要修改模型中的任何內(nèi)容,也不需要執(zhí)行我上面所寫(xiě)的操作。設(shè)置Trainer(precision=16)就可以了。
trainer?=?Trainer(amp_level='O2',?use_amp=False)
trainer.fit(model)
現(xiàn)在,事情變得非常有趣了。有3種(也許更多?)方法來(lái)進(jìn)行多GPU訓(xùn)練。
分batch訓(xùn)練

第一種方法被稱(chēng)為“分batch訓(xùn)練”。該策略將模型復(fù)制到每個(gè)GPU上,每個(gè)GPU獲得batch的一部分。
#?copy?model?on?each?GPU?and?give?a?fourth?of?the?batch?to?each
model?=?DataParallel(model,?devices=[0,?1,?2?,3])
#?out?has?4?outputs?(one?for?each?gpu)
out?=?model(x.cuda(0))
在lightning中,你只需要增加GPUs的數(shù)量,然后告訴trainer,其他什么都不用做。
#?ask?lightning?to?use?4?GPUs?for?training
trainer?=?Trainer(gpus=[0,?1,?2,?3])
trainer.fit(model)
模型分布訓(xùn)練

有時(shí)你的模型可能太大不能完全放到內(nèi)存中。例如,帶有編碼器和解碼器的序列到序列模型在生成輸出時(shí)可能會(huì)占用20GB RAM。在本例中,我們希望將編碼器和解碼器放在獨(dú)立的GPU上。
#?each?model?is?sooo?big?we?can't?fit?both?in?memory
encoder_rnn.cuda(0)
decoder_rnn.cuda(1)
#?run?input?through?encoder?on?GPU?0
encoder_out?=?encoder_rnn(x.cuda(0))
#?run?output?through?decoder?on?the?next?GPU
out?=?decoder_rnn(encoder_out.cuda(1))
#?normally?we?want?to?bring?all?outputs?back?to?GPU?0
out?=?out.cuda(0)
對(duì)于這種類(lèi)型的訓(xùn)練,在Lightning中不需要指定任何GPU,你應(yīng)該把LightningModule中的模塊放到正確的GPU上。
class?MyModule(LightningModule):
????def?__init__():
????????self.encoder?=?RNN(...)
????????self.decoder?=?RNN(...)
????def?forward(x):
????????#?models?won't?be?moved?after?the?first?forward?because?
????????#?they?are?already?on?the?correct?GPUs
????????self.encoder.cuda(0)
????????self.decoder.cuda(1)
????????out?=?self.encoder(x)
????????out?=?self.decoder(out.cuda(1))
????????
#?don't?pass?GPUs?to?trainer
model?=?MyModule()
trainer?=?Trainer()
trainer.fit(model)
兩者混合
在上面的情況下,編碼器和解碼器仍然可以從并行化操作中獲益。
#?change?these?lines
self.encoder?=?RNN(...)
self.decoder?=?RNN(...)
#?to?these
#?now?each?RNN?is?based?on?a?different?gpu?set
self.encoder?=?DataParallel(self.encoder,?devices=[0,?1,?2,?3])
self.decoder?=?DataParallel(self.encoder,?devices=[4,?5,?6,?7])
#?in?forward...
out?=?self.encoder(x.cuda(0))
#?notice?inputs?on?first?gpu?in?device
sout?=?self.decoder(out.cuda(4))??#?<---?the?4?here
使用多個(gè)GPU時(shí)要考慮的注意事項(xiàng):
如果模型已經(jīng)在GPU上了,model.cuda()不會(huì)做任何事情。 總是把輸入放在設(shè)備列表中的第一個(gè)設(shè)備上。 在設(shè)備之間傳輸數(shù)據(jù)是昂貴的,把它作為最后的手段。 優(yōu)化器和梯度會(huì)被保存在GPU 0上,因此,GPU 0上使用的內(nèi)存可能會(huì)比其他GPU大得多。

每臺(tái)機(jī)器上的每個(gè)GPU都有一個(gè)模型的副本。每臺(tái)機(jī)器獲得數(shù)據(jù)的一部分,并且只在那部分上訓(xùn)練。每臺(tái)機(jī)器都能同步梯度。
如果你已經(jīng)做到了這一步,那么你現(xiàn)在可以在幾分鐘內(nèi)訓(xùn)練Imagenet了!這并沒(méi)有你想象的那么難,但是它可能需要你對(duì)計(jì)算集群的更多知識(shí)。這些說(shuō)明假設(shè)你正在集群上使用SLURM。
Pytorch允許多節(jié)點(diǎn)訓(xùn)練,通過(guò)在每個(gè)節(jié)點(diǎn)上復(fù)制每個(gè)GPU上的模型并同步梯度。所以,每個(gè)模型都是在每個(gè)GPU上獨(dú)立初始化的,本質(zhì)上獨(dú)立地在數(shù)據(jù)的一個(gè)分區(qū)上訓(xùn)練,除了它們都從所有模型接收梯度更新。
在高層次上:
在每個(gè)GPU上初始化一個(gè)模型的副本(確保設(shè)置種子,讓每個(gè)模型初始化到相同的權(quán)重,否則它會(huì)失敗)。 將數(shù)據(jù)集分割成子集(使用DistributedSampler)。每個(gè)GPU只在它自己的小子集上訓(xùn)練。 在.backward()上,所有副本都接收到所有模型的梯度副本。這是模型之間唯一一次的通信。
Pytorch有一個(gè)很好的抽象,叫做DistributedDataParallel,它可以幫你實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能。要使用DDP,你需要做4的事情:
def?tng_dataloader():
?????d?=?MNIST()
?????
?????#?4:?Add?distributed?sampler
?????#?sampler?sends?a?portion?of?tng?data?to?each?machine
?????dist_sampler?=?DistributedSampler(dataset)
?????dataloader?=?DataLoader(d,?shuffle=False,?sampler=dist_sampler)
?????
def?main_process_entrypoint(gpu_nb):
?????#?2:?set?up?connections??between?all?gpus?across?all?machines
?????#?all?gpus?connect?to?a?single?GPU?"root"
?????#?the?default?uses?env://
?????world?=?nb_gpus?*?nb_nodes
?????dist.init_process_group("nccl",?rank=gpu_nb,?world_size=world)
?????
?????#?3:?wrap?model?in?DPP
?????torch.cuda.set_device(gpu_nb)
?????model.cuda(gpu_nb)
?????model?=?DistributedDataParallel(model,?device_ids=[gpu_nb])
?????
?????#?train?your?model?now...
?????
if??__name__?==?'__main__':
?????#?1:?spawn?number?of?processes
?????#?your?cluster?will?call?main?for?each?machine
?????mp.spawn(main_process_entrypoint,?nprocs=8)
然而,在Lightning中,只需設(shè)置節(jié)點(diǎn)數(shù)量,它就會(huì)為你處理其余的事情。
#?train?on?1024?gpus?across?128?nodes
trainer?=?Trainer(nb_gpu_nodes=128,?gpus=[0,?1,?2,?3,?4,?5,?6,?7])
Lightning還附帶了一個(gè)SlurmCluster管理器,可以方便地幫助你提交SLURM作業(yè)的正確詳細(xì)信息。
事實(shí)證明,distributedDataParallel比DataParallel快得多,因?yàn)樗粓?zhí)行梯度同步的通信。所以,一個(gè)好的hack是使用distributedDataParallel替換DataParallel,即使是在單機(jī)上進(jìn)行訓(xùn)練。
在Lightning中,這很容易通過(guò)將distributed_backend設(shè)置為ddp和設(shè)置GPUs的數(shù)量來(lái)實(shí)現(xiàn)。
#?train?on?4?gpus?on?the?same?machine?MUCH?faster?than?DataParallel
trainer?=?Trainer(distributed_backend='ddp',?gpus=[0,?1,?2,?3])
對(duì)模型加速的思考
盡管本指南將為你提供了一系列提高網(wǎng)絡(luò)速度的技巧,但我還是要給你解釋一下如何通過(guò)查找瓶頸來(lái)思考問(wèn)題。
我將模型分成幾個(gè)部分:
首先,我要確保在數(shù)據(jù)加載中沒(méi)有瓶頸。為此,我使用了我所描述的現(xiàn)有數(shù)據(jù)加載解決方案,但是如果沒(méi)有一種解決方案滿(mǎn)足你的需要,請(qǐng)考慮離線(xiàn)處理和緩存到高性能數(shù)據(jù)存儲(chǔ)中,比如h5py。
接下來(lái)看看你在訓(xùn)練步驟中要做什么。確保你的前向傳播速度快,避免過(guò)多的計(jì)算以及最小化CPU和GPU之間的數(shù)據(jù)傳輸。最后,避免做一些會(huì)降低GPU速度的事情(本指南中有介紹)。
接下來(lái),我試圖最大化我的batch size,這通常是受GPU內(nèi)存大小的限制。現(xiàn)在,需要關(guān)注在使用大的batch size的時(shí)候如何在多個(gè)GPUs上分布并最小化延遲(比如,我可能會(huì)嘗試著在多個(gè)gpu上使用8000 +的有效batch size)。
然而,你需要小心大的batch size。針對(duì)你的具體問(wèn)題,請(qǐng)查閱相關(guān)文獻(xiàn),看看人們都忽略了什么!
英文原文:https://towardsdatascience.com/9-tips-for-training-lightning-fast-neural-networks-in-pytorch-8e63a502f565
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