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          MedMNIST:上海交大發(fā)布醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域的MNIST(附下載)

          共 1422字,需瀏覽 3分鐘

           ·

          2022-07-09 18:58

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          重磅干貨,第一時(shí)間送達(dá)

          今天上海交大的研究學(xué)者發(fā)文 MedMNIST Classification Decathlon: A Lightweight AutoML Benchmark for Medical Image Analysis ,公布了其收集整理的10個(gè)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的圖像數(shù)據(jù)集MedMNIST,旨在促進(jìn)AutoML(自動(dòng)機(jī)器學(xué)習(xí))在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)研究。


          作者信息:


          這10個(gè)數(shù)據(jù)集示例:



          該數(shù)據(jù)集特點(diǎn):


          • 利于研究教學(xué):數(shù)據(jù)來(lái)自具有知識(shí)共享(CC)許可的多個(gè)開放式醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)集,易于用于教育目的。

          • 標(biāo)準(zhǔn)化:將數(shù)據(jù)預(yù)處理為相同格式,無(wú)需用戶了解任何背景知識(shí)

          • 多樣性:涵蓋了各種數(shù)據(jù)規(guī)模(從100到100,000)和任務(wù)(二分類/多類分類,有序回歸和多標(biāo)簽學(xué)習(xí))。

          • 輕量級(jí):28×28的圖像大小適合快速原型設(shè)計(jì)和試驗(yàn)多模態(tài)機(jī)器學(xué)習(xí)和AutoML算法。


          該數(shù)據(jù)集相關(guān)統(tǒng)計(jì):



          可見覆蓋了常見的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)源:病理圖片、胸部X光、皮膚鏡、超聲、眼底攝影、OCT、CT等。


          另外,作者提供了代碼,在此10個(gè)數(shù)據(jù)集上進(jìn)行了人工設(shè)計(jì)網(wǎng)絡(luò)和常見AutoML工具設(shè)計(jì)的模型的評(píng)測(cè),結(jié)果如下:



          可見:

          • Google AutoML Vision 在大多數(shù)情況下都表現(xiàn)不錯(cuò),但相比手工設(shè)計(jì)的 ResNet-18/50也有遜色的時(shí)候;

          • auto-sklearn 的表現(xiàn)一直很穩(wěn)定的差 /sad;

          • AutoKeras 在數(shù)據(jù)量較大的數(shù)據(jù)集上表現(xiàn)很好,在數(shù)據(jù)量小時(shí)往往不佳。


          總之,以上AutoML工具在MedMNIST面前沒有完美勝出者,這也說明MedMNIST對(duì)于研究者來(lái)說是個(gè)好數(shù)據(jù)集。

          最后附上項(xiàng)目主頁(yè):

          https://medmnist.github.io/

          論文地址:

          https://arxiv.org/abs/2010.14925

          Demo代碼地址:

          https://github.com/MedMNIST/MedMNIST

          好消息!

          小白學(xué)視覺知識(shí)星球

          開始面向外開放啦??????




          下載1:OpenCV-Contrib擴(kuò)展模塊中文版教程
          在「小白學(xué)視覺」公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù):擴(kuò)展模塊中文教程,即可下載全網(wǎng)第一份OpenCV擴(kuò)展模塊教程中文版,涵蓋擴(kuò)展模塊安裝、SFM算法、立體視覺、目標(biāo)跟蹤、生物視覺、超分辨率處理等二十多章內(nèi)容。

          下載2:Python視覺實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目52講
          小白學(xué)視覺公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù):Python視覺實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目即可下載包括圖像分割、口罩檢測(cè)、車道線檢測(cè)、車輛計(jì)數(shù)、添加眼線、車牌識(shí)別、字符識(shí)別、情緒檢測(cè)、文本內(nèi)容提取、面部識(shí)別等31個(gè)視覺實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目,助力快速學(xué)校計(jì)算機(jī)視覺。

          下載3:OpenCV實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目20講
          小白學(xué)視覺公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù):OpenCV實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目20講即可下載含有20個(gè)基于OpenCV實(shí)現(xiàn)20個(gè)實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目,實(shí)現(xiàn)OpenCV學(xué)習(xí)進(jìn)階。

          交流群


          歡迎加入公眾號(hào)讀者群一起和同行交流,目前有SLAM、三維視覺、傳感器自動(dòng)駕駛、計(jì)算攝影、檢測(cè)、分割、識(shí)別、醫(yī)學(xué)影像、GAN、算法競(jìng)賽等微信群(以后會(huì)逐漸細(xì)分),請(qǐng)掃描下面微信號(hào)加群,備注:”昵稱+學(xué)校/公司+研究方向“,例如:”張三 + 上海交大 + 視覺SLAM“。請(qǐng)按照格式備注,否則不予通過。添加成功后會(huì)根據(jù)研究方向邀請(qǐng)進(jìn)入相關(guān)微信群。請(qǐng)勿在群內(nèi)發(fā)送廣告,否則會(huì)請(qǐng)出群,謝謝理解~


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