MedMNIST:上海交大發(fā)布醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域的MNIST(附下載)
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今天上海交大的研究學(xué)者發(fā)文 MedMNIST Classification Decathlon: A Lightweight AutoML Benchmark for Medical Image Analysis ,公布了其收集整理的10個(gè)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的圖像數(shù)據(jù)集MedMNIST,旨在促進(jìn)AutoML(自動(dòng)機(jī)器學(xué)習(xí))在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)研究。
作者信息:

這10個(gè)數(shù)據(jù)集示例:

該數(shù)據(jù)集特點(diǎn):
利于研究教學(xué):數(shù)據(jù)來(lái)自具有知識(shí)共享(CC)許可的多個(gè)開放式醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)集,易于用于教育目的。
標(biāo)準(zhǔn)化:將數(shù)據(jù)預(yù)處理為相同格式,無(wú)需用戶了解任何背景知識(shí)
多樣性:涵蓋了各種數(shù)據(jù)規(guī)模(從100到100,000)和任務(wù)(二分類/多類分類,有序回歸和多標(biāo)簽學(xué)習(xí))。
輕量級(jí):28×28的圖像大小適合快速原型設(shè)計(jì)和試驗(yàn)多模態(tài)機(jī)器學(xué)習(xí)和AutoML算法。
該數(shù)據(jù)集相關(guān)統(tǒng)計(jì):
可見覆蓋了常見的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)源:病理圖片、胸部X光、皮膚鏡、超聲、眼底攝影、OCT、CT等。
另外,作者提供了代碼,在此10個(gè)數(shù)據(jù)集上進(jìn)行了人工設(shè)計(jì)網(wǎng)絡(luò)和常見AutoML工具設(shè)計(jì)的模型的評(píng)測(cè),結(jié)果如下:

可見:
Google AutoML Vision 在大多數(shù)情況下都表現(xiàn)不錯(cuò),但相比手工設(shè)計(jì)的 ResNet-18/50也有遜色的時(shí)候;
auto-sklearn 的表現(xiàn)一直很穩(wěn)定的差 /sad;
AutoKeras 在數(shù)據(jù)量較大的數(shù)據(jù)集上表現(xiàn)很好,在數(shù)據(jù)量小時(shí)往往不佳。
總之,以上AutoML工具在MedMNIST面前沒有完美勝出者,這也說明MedMNIST對(duì)于研究者來(lái)說是個(gè)好數(shù)據(jù)集。
最后附上項(xiàng)目主頁(yè):
https://medmnist.github.io/
論文地址:
https://arxiv.org/abs/2010.14925
Demo代碼地址:
https://github.com/MedMNIST/MedMNIST
好消息!
小白學(xué)視覺知識(shí)星球
開始面向外開放啦??????
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