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          iBiology |專業(yè)的生信科普網(wǎng)站

          共 2699字,需瀏覽 6分鐘

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          2021-06-02 19:25



          劈個(gè)叉:B站上科普向的視頻和UP主燦若繁星。作為一名資深潛水員,生信寶典在2018年入駐B站并且分享了一些繪圖和網(wǎng)站教程,后續(xù)也將陸續(xù)上傳其他視頻內(nèi)容,感興趣的讀者不妨關(guān)注了解一下 (推薦我們?cè)贐站免費(fèi)的轉(zhuǎn)錄組課程)。

          iBiology是可以在線互動(dòng)、旨在分享生命科學(xué)領(lǐng)域的前沿研究報(bào)道的科普性質(zhì)網(wǎng)站;重點(diǎn)是免費(fèi)的在線交互式課程和牛人talk,視頻是基于youtube播放器,因此在線播放需要科學(xué)上網(wǎng),覺得麻煩的話可以手動(dòng)下載視頻本地觀看,下載速度取決于網(wǎng)速 (在線的好處是可以有多語字幕,下載到本地的話,只有部分視頻會(huì)提供英語字幕,不論主講人語種)。


          探門 |檢索

          任何事物劃分到細(xì)都會(huì)成了“XX說”一類,更別說是龐大的生命科學(xué)學(xué)科,想要探一探這里的路,iBiologyExplore有很多方向。

          無論你是對(duì)生科好奇的路人,還是生物學(xué)的學(xué)生,研究員或者教育工作者,這里都提供了相應(yīng)的在線生物課程。

          自主選擇的內(nèi)容涵蓋有:

          • 研究型talk:生物化學(xué),生物工程,生物物理,細(xì)胞生物,發(fā)育和干細(xì)胞,生態(tài),進(jìn)化,遺傳學(xué)和基因調(diào)控,人體疾病,免疫學(xué),微生物,神經(jīng)科學(xué),植物生物和技術(shù)??傆心銓W(xué)的。

          • 職業(yè):職業(yè)探索,NRMN(National Research Mentoring Network)資源,專業(yè)發(fā)展

          • 故事:背景突破,采訪和簡(jiǎn)介,科學(xué)和社會(huì)。從這三個(gè)方面來走近科學(xué)家們,走近科學(xué)。

          • 其他語言的talk:其中中文篇有兩則,分別是顏寧老師的膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白講座,鄭詣先教授的心路歷程之從想成為一名作家到專于生物研究。


          explore的話還可以從playlist(有專門的諾貝爾獲獎(jiǎng)?wù)?/strong>授課合集, Bioinformatics集合),speaker(可按照姓名第一個(gè)字母來搜索),talks(世界上最好的科學(xué)家,科學(xué)政策專家和科學(xué)教育工作者的全部視頻集)三個(gè)方面來開始相關(guān)主題演講和系列講座,還有背后的iBiology去專注時(shí)態(tài)新聞和制作技術(shù)分享。(PS.頁面右上角始終有個(gè)屬于檢索your keyword的框框)

          宴起| 課程

          課程頁面

          主要分為四大塊,視頻+概覽(overview)+作者介紹+相關(guān)作品推薦,其中相關(guān)作品鏈接的都是該領(lǐng)域十分優(yōu)秀的雜志和文章。每個(gè)課程會(huì)標(biāo)有適合群體圖標(biāo),可以定位是否符合現(xiàn)階段的學(xué)習(xí)需求。

          課程分布

          • 科學(xué)技能:成為一名偉大的魔法師科學(xué)家需要具備的三大“圣器”——活點(diǎn)地圖之“一份科學(xué)之旅規(guī)劃”,隱身斗篷之“生命科學(xué)家的商業(yè)學(xué)習(xí)”和接骨木魔杖之“必備實(shí)驗(yàn)技能”。但首先,你需要收到一封貓頭鷹的信(注冊(cè)),然后通過九又四分之三車站(登錄),之后就可以正式踏上科學(xué)之旅(開始征服星辰大海)。

          • 專業(yè)的顯微鏡科普:包括有適合系統(tǒng)學(xué)習(xí)的綜合顯微鏡系列、適合新生或入門者學(xué)習(xí)的顯微鏡系列和講解生命循環(huán)的數(shù)據(jù)集圖像的生物圖像分析系列。關(guān)于顯微鏡的,冷凍電鏡技術(shù)Cryo-EM在今年上半年的國內(nèi)CNS文章中尤為耀眼,基于這項(xiàng)技術(shù),施老團(tuán)隊(duì)已連續(xù)發(fā)了多篇science,這里也有關(guān)于單顆粒Cryo-EM的視頻介紹,主講人是程亦凡博士,他用兩節(jié)課介紹了單顆粒Cryo-EM的原理及其如何提高原子分辨率,值得一看。

          • FLIPPED COURSES(主題展):包含有細(xì)胞生物、工程生活、演化和免疫,這部分根據(jù)主題設(shè)計(jì)安排了一節(jié)節(jié)的課程,十分適用于作為教學(xué)工作者的教學(xué)材料。

          舉個(gè)例子

          檢索主要從兩個(gè)角度出發(fā)。

          首先,從全局小框檢索sequence,想了解關(guān)于高通量測(cè)序技術(shù)的描述,這次課程是由加州大學(xué)舊金山分校生物化學(xué)與生物物理系助理教授兼高級(jí)技術(shù)中心(CAT)主任的Eric Chow主講的三節(jié)課,第一節(jié)從基礎(chǔ)的DNA鏈結(jié)構(gòu)開始,介紹了測(cè)序儀檢測(cè)原理和結(jié)果顯示,除了最常用的illumina測(cè)序儀,還描述了兩種測(cè)long read的測(cè)序儀技術(shù),Pacific Biosciences和Oxford Nanoporehe。并且在第一節(jié)結(jié)尾簡(jiǎn)要介紹了高通量測(cè)序技術(shù)在醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用,例如侵入性較小的產(chǎn)前檢測(cè)或癌癥檢測(cè)。第二三節(jié)是兩個(gè)操作視頻,分別是用beads純化DNA樣本和Agilent Bioanalyzer判定核酸樣品質(zhì)量。

          視頻適合學(xué)生,研究員和教育工作者觀看

          而談到高通量測(cè)序,我們?cè)購?code style="font-size: 0.85em;font-family: Consolas, Inconsolata, Courier, monospace;margin: 0px 0.15em;padding: 0px 0.3em;white-space: pre-wrap;border-width: 1px;border-style: solid;border-color: rgb(234, 234, 234);background-color: rgb(248, 248, 248);border-radius: 3px;display: inline;">explore-all playlists-Bioinformatics的檢索路徑找到生物信息學(xué)上關(guān)于測(cè)得的基因組信息說明。主講人是David Haussler,他是加州大學(xué)圣克魯茲分校(UCSC)基因組學(xué)研究所的科學(xué)主任和霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所(HHMI)的研究員,在本次課程他介紹了比較不同組織基因組的意義,尤其是在醫(yī)學(xué)和生物上的。

          最后

          播放列表的10個(gè)著名發(fā)現(xiàn)、10個(gè)能挑起求知欲的訪談,10個(gè)必看生物影片,6個(gè)流行技術(shù)訪談和12個(gè)開闊視野的顯微鏡影片,這些名字雖然聽著像是家庭群里面轉(zhuǎn)發(fā)的“十個(gè)方法滋潤你這個(gè)秋天的發(fā)際線 ”和“聽了這6個(gè)訪談的人都成功脫單”之類,但真實(shí)內(nèi)容,對(duì)于充電和課外閱讀,都值得一探究竟。

          :https://www.ibiology.org/

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