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          眼動數(shù)據(jù)分析工具包合集:R語言篇

          共 8010字,需瀏覽 17分鐘

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          2021-12-28 09:13

          本次推文主要介紹用于進(jìn)行眼動數(shù)據(jù)處理和統(tǒng)計(jì)分析的工具包,其中大多數(shù)工具包都可以免費(fèi)下載源代碼,但其中部分工具包缺少明確的使用許可協(xié)議。需要特別注意的一點(diǎn)是,有些工具包雖然可以免費(fèi)下載,但不是開源的。但無論如何,如果你的研究中使用了相關(guān)的工具包進(jìn)行眼動數(shù)據(jù)的處理與分析,請記得規(guī)范地引用相關(guān)文獻(xiàn)或研究。
          Ps:雖然我們進(jìn)行了盡可能的收集與整理,但難免有缺漏。如果您有新的補(bǔ)充,歡迎在評論區(qū)留言進(jìn)行補(bǔ)充,如果您的補(bǔ)充被入選,我們將給予一定的報酬或贈送一本相關(guān)書籍,以期能整理出相對完善的工具包列表。
          眼動數(shù)據(jù)分析工具包合集共有4個系列,涵蓋R語言、Python、Matlab和其他語言。鑒于工具包的數(shù)量和推文內(nèi)容的篇幅考慮,我們將拆分成多個系列進(jìn)行推送,以便于讀者能有更好的閱讀體驗(yàn)。本期我們主要介紹基于R語言的眼動數(shù)據(jù)分析工具包,截止發(fā)文共有41個工具包,下面將從簡介、開發(fā)者、最近更新時間、獲取鏈接、文獻(xiàn)引用等方面一一介紹。

          第一部分 基于R語言的工具包
          1.1??bdots
          提供用于分析眼球追蹤數(shù)據(jù)以及由許多連續(xù)測試組成的其他類型的高度相關(guān)數(shù)據(jù)的技術(shù)。我們解釋了如何以包使用的方式設(shè)置數(shù)據(jù),如何使用內(nèi)置函數(shù)分析數(shù)據(jù),以及如何進(jìn)行t檢驗(yàn)。
          開發(fā)者:?Michael Seedorff?
          最近更新時間:2015年10月
          獲取鏈接:https://github.com/MichaelSeedorff/bdots
          https://cran.rstudio.org/web/packages/bdots/index.html

          1.2?EDF2R
          通過 RCpp 將 SRR *edf 文件直接讀入 R 的小插件。
          開發(fā)者:Hedderik van Rijn
          最近更新時間:2016 年 4 月
          獲取鏈接:https : //github.com/hedderik/EDF2R/tree/master/R

          1.3 edfR
          用于直接通過 RCpp 讀取 SRR *edf 文件的 R 包。代碼庫是 R 和 C++,并且需要 SRR 的 edfapi。僅限 Linux 和 OSX(無 Windows)。
          開發(fā)者:Jason Hubbard
          最近更新時間:2016 年 9 月
          獲取鏈接:https://github.com/jashubbard/edfR
          https://www.sr-support.com/showthread.php?1416-Reading-EDF-files-in-GNU-R(需要通過免費(fèi)帳戶登錄)

          1.4? em2
          “用于計(jì)算心理語言學(xué)閱讀時間度量的包”,即區(qū)域閱讀時間度量。R包,底層代碼多為C++。
          開發(fā)者:Pavel Logacev,Gábor Csárdi
          最近更新時間:2013 年 8 月
          獲取鏈接:https://github.com/cran/em2

          1.5?emov
          用于分析注視/掃視的工具。
          開發(fā)者:Simon Schwab
          最近更新時間:2016年4月
          獲取鏈接:https://cran.r-project.org/web/packages/emov/
          https://github.com/schw4b/emov

          1.6?ETRAN
          用于注視分析和繪圖。
          開發(fā)者:Alexander Zhegallo
          最近更新時間:2015年7月
          獲取鏈接:https://sites.google.com/site/azhegallo/
          文獻(xiàn)引用:Zhegallo, A. V., & Marmalyuk, P. A. (2015). ETRAN—R extension package for eye tracking results analysis. Perception, 44(8-9), 1129-1135.

          1.7?eyEdu
          用于滿足基本眼動研究教育目的的眼動分析 R 包。
          開發(fā)者:Sebastian P. Korinth
          最近更新時間:2021年9月
          獲取鏈接:https://github.com/SebastianKorinth/eyEdu

          1.8?eyelinker
          將 SRR *ASC 文件轉(zhuǎn)換為data.frames 的工具。
          開發(fā)者:Simon Barthelmé
          最近更新時間:2017年9月
          獲取鏈接:https://github.com/dahtah/eyelinker

          1.9?eyelinkReader
          通過 eyelink API 的 RCpp 接口將 SRR edf 文件直接讀入 R。
          開發(fā)者:tz-lom
          最近更新時間:2015年3月
          獲取鏈接:https://github.com/tz-lom/eyelinkReader

          1.10? eyeread
          用于從眼動追蹤系統(tǒng)讀取二進(jìn)制數(shù)據(jù)文件的 R 庫。僅適用于 EyeLink 1000 和 64 位 linux 系統(tǒng)。
          開發(fā)者:Dale Barr
          最近更新時間:2016年5月
          獲取鏈接:https://github.com/dalejbarr/eyeread

          1.11?eyetracking
          計(jì)算像素到像素和眼睛到屏幕的距離。
          開發(fā)者:Ryan M. Hope
          最近更新時間:2012 年 10 月
          獲取鏈接:https://cran.r-project.org/web/packages/eyetracking/

          1.12?eyetrackingR
          eyetrackingR是一個 R 包,旨在使處理眼動追蹤數(shù)據(jù)更容易。它處理沿管道的任務(wù),從原始數(shù)據(jù)到分析和可視化
          開發(fā)者:Jacob
          最近更新時間:2021年8月
          獲取鏈接:http://www.eyetracking-r.com/(官方主頁)
          https://github.com/jwdink/eyetrackingR
          https://cran.r-project.org/web/packages/eyetrackingR/

          1.13?eyetracking-dashboard-demo
          ET 數(shù)據(jù)的基本演示儀表盤。
          開發(fā)者:TJ Mahr
          最近更新時間:2017年7月
          獲取鏈接:https://github.com/tjmahr/eyetracking-dashboard-demo

          1.14?eyeTrackR
          專注于 SRR 系統(tǒng),用于分析眼動追蹤數(shù)據(jù)的 R 包。尤其是 DataViewer 的結(jié)果報告輸出。
          開發(fā)者:hjgodwin
          最近更新時間:2020年3月
          獲取鏈接:https://github.com/hjgodwin/eyeTrackR
          http://www.psychwire.co.uk/(官方主頁)

          1.15 FDBeye
          FDBeye 是一組工具,可輕松處理眼動儀數(shù)據(jù)。它是關(guān)于采集后數(shù)據(jù)處理的。它專注于涉及 SRR Eyelink 系統(tǒng)數(shù)據(jù)的分析過程。
          開發(fā)者:Dave Braze
          最近更新時間:2019年6月
          獲取鏈接:https://github.com/davebraze/FDBeye

          1.16 fix_align.R
          在多行閱讀范式中自動調(diào)整注視點(diǎn)的 y 坐標(biāo),以便每個都落在特定的文本行上。正如所寫,代碼特定于 SRR 系統(tǒng)(需要 SRR ASC 文件作為輸入)。在沒有事先獲得麻省理工學(xué)院的明確許可的情況下,不得修改、重新分發(fā)甚至使用代碼。
          開發(fā)者:
          最近更新時間:2013年
          獲取鏈接:http://www.psych.umass.edu/PACLab/resources/
          文獻(xiàn)引用:Cohen, A. L. (2013). Software for the automatic correction of recorded eye fixation locations in reading experiments. Behavior research methods, 45(3), 679-683.

          1.17?gazepath
          用于注視/掃視檢測的功能。
          開發(fā)者:Daan van Renswoude & Ingmar Visser
          最近更新時間:2020年2月
          獲取鏈接:https://github.com/cran/gazepath
          https://cran.r-project.org/web/packages/gazepath/
          文獻(xiàn)引用:van Renswoude, D. R., Raijmakers, M. E., Koornneef, A., Johnson, S. P., Hunnius, S., & Visser, I. (2018). Gazepath: An eye-tracking analysis tool that accounts for individual differences and data quality. Behavior research methods, 50(2), 834-852.

          1.18 gazer
          用于讀取眼動追蹤數(shù)據(jù)(SSR eyelink 注視報告)的功能,將其格式化以進(jìn)行生長曲線分析,從注視坐標(biāo)轉(zhuǎn)換為感興趣的區(qū)域,合并,聚合等。
          開發(fā)者:Dan Mirman
          最近更新時間:2018年7月
          獲取鏈接:https://github.com/dmirman-zz/gazer

          1.19?Gazetools
          用于處理和分類眼睛注視數(shù)據(jù)(眨眼、注視等)的函數(shù)。以 SMI 跟蹤器為中心,但包括一些通常有用的東西。
          開發(fā)者:Ryan Hope
          最近更新時間:2016年3月
          獲取鏈接:https://github.com/RyanHope/gazetools
          http://ryanhope.github.io/gazetools/

          1.20 hybridEyeEEG
          用于處理來自包含 EEG 記錄和眼動追蹤的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的函數(shù)。ET bit 似乎專注于 SRR eyelink 系統(tǒng)。
          開發(fā)者:Anastasiia Fedorova
          最近更新時間:2017年6月
          獲取鏈接:https://github.com/mayenok/hybridEyeEEG

          1.21?itrackR
          edfR 的衍生版本,以促進(jìn)將 SRR 眼鏈接數(shù)據(jù)(注視、眼跳、瞳孔測量)與外部(行為)數(shù)據(jù)合并以進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和可視化。
          開發(fā)者:Jason Hubbard
          最近更新時間:2017年4月
          獲取鏈接:https://github.com/jashubbard/itrackR

          1.22 itrak
          處理視覺注意力實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的函數(shù):注意力偏差和瞳孔測量。
          開發(fā)者:Jason Shumake
          最近更新時間:2018年11月
          獲取鏈接:https://github.com/jashu/itrak

          1.23 lookr
          提供了一組用于分析由 Learning to Talk 項(xiàng)目執(zhí)行的邊看邊聽眼動追蹤實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的工具。
          開發(fā)者:TJ Mahr
          最近更新時間:2017年8月
          獲取鏈接:https://github.com/tjmahr/lookr

          1.24 littlelisteners
          用于處理視覺世界和邊聽邊看數(shù)據(jù)的函數(shù)。lookr的后續(xù)開發(fā)版本。遵循 tidyverse R 編程并嘗試不受實(shí)驗(yàn)室和設(shè)備的限制。
          開發(fā)者:TJ Mahr
          最近更新時間:2021年6月
          獲取鏈接:https://github.com/tjmahr/littlelisteners


          1.25?pdata
          旨在“處理大規(guī)模教育評估的數(shù)據(jù)分析和可視化”,但也包括一些用于可視化注視數(shù)據(jù)的工具。參見 heatmapanalysis() 和 scanpathPlot()。
          開發(fā)者:Gary Feng
          最近更新時間:2016年4月
          獲取鏈接:https://github.com/garyfeng/pdata


          1.26?pR
          “用于預(yù)處理瞳孔反應(yīng)數(shù)據(jù)的函數(shù):眨眼檢測、下采樣、過濾和平滑以及一些分析代碼。廣泛使用 data.table 語法以提高速度。
          開發(fā)者:Hedderik van Rijn
          最近更新時間:2015年9月
          獲取鏈接:https://github.com/hedderik/pR

          1.27 prepre
          “用于預(yù)處理瞳孔反應(yīng)數(shù)據(jù)的函數(shù):眨眼檢測、下采樣、過濾和平滑以及一些分析代碼。廣泛使用 data.table 語法以提高速度。
          開發(fā)者:Hedderik van Rijn
          最近更新時間:2015年2月
          獲取鏈接:https://github.com/vr-vr/prepre

          1.28 Pupil
          用于處理和提取使用 EyeTracking 平臺 Tobi Tx300 提取的瞳孔直徑數(shù)據(jù)的算法。
          開發(fā)者:Rafael Nobre Orsi
          最近更新時間:2018年6月
          獲取鏈接:https://github.com/RafaelOrsi/PupilAnalysis

          1.29?pupillometry
          用于預(yù)處理瞳孔數(shù)據(jù)的 R 包。該包包含預(yù)處理管道中不同步驟的各種功能,例如去閃爍、插值、平滑和基線校正。
          開發(fā)者:Jason Tsukahara
          最近更新時間:2019年1月
          獲取鏈接:https://github.com/dr-JT/pupillometry
          https://dr-jt.github.io/pupillometry/
          文獻(xiàn)引用:Math?t, S., Fabius, J., Van Heusden, E., & Van der Stigchel, S. (2018). Safe and sensible preprocessing and baseline correction of pupil-size data. Behavior research methods, 50(1), 94-106.

          1.30 PupillometryR
          用于瞳孔測量數(shù)據(jù)預(yù)處理和分析的 R 包。
          開發(fā)者:Sam Forbes
          最近更新時間:2021年11月
          獲取鏈接:https://github.com/samhforbes/PupillometryR

          1.31 pupilParse
          用于處理瞳孔測量數(shù)據(jù)的輔助函數(shù):“當(dāng)前包目前具有 alpha 質(zhì)量 - 使用風(fēng)險自負(fù)。”
          開發(fā)者:thohag
          最近更新時間:2017年6月
          獲取鏈接:https://github.com/thohag/pupilParse

          1.32 pupilPlot
          使用面板來繪制瞳孔數(shù)據(jù)。
          開發(fā)者:thohag
          最近更新時間:2017年4月
          獲取鏈接:https://github.com/thohag/pupilPlot

          1.33 PupilPre
          使用 SR Research Eyelink 眼動儀收集的瞳孔測量數(shù)據(jù)需要大量預(yù)處理。該包包含用于準(zhǔn)備瞳孔擴(kuò)張數(shù)據(jù)以進(jìn)行可視化和統(tǒng)計(jì)分析的功能。具體來說,它提供了一系列有助于數(shù)據(jù)驗(yàn)證、消除閃爍/偽影、下采樣和基線等的功能。此外,還提供了用于創(chuàng)建總平均和條件平均圖的繪圖功能。有關(guān)功能示例,請參閱小插圖。該軟件包專為使用 SR Research 數(shù)據(jù)查看器中創(chuàng)建的示例報告處理通過 SR Research Eyelink 眼動儀收集的數(shù)據(jù)。
          開發(fā)者:Aki-Juhani Kyr?l?inen, Vincent Porretta, Jacolien van Rij, Juhani J?rvikivi
          最近更新時間:2020年3月
          獲取鏈接:https://cran.r-project.org/web/packages/PupilPre/index.html

          1.34 readSMI
          將 SMI 眼動儀文件讀入 R 數(shù)據(jù)表的函數(shù)。必須先手動“使用 IDF 轉(zhuǎn)換器將您的 iViewX 數(shù)據(jù)文件 (idf) 轉(zhuǎn)換為純文本,然后再使用此包”。
          開發(fā)者:thohag,Waldir Leoncio
          最近更新時間:2020年6月
          獲取鏈接:https://github.com/thohag/readSMI

          1.35?saccades
          用于檢測原始眼動追蹤數(shù)據(jù)中的注視點(diǎn)的函數(shù)。檢測是使用 Ralf Engbert 和 Reinhold Kliegl 在 2003 年提出的基于速度的掃視檢測算法完成的。當(dāng)眼球運(yùn)動速度超過某個閾值時,該算法將片段標(biāo)記為掃視。兩次掃視之間的任何東西都被認(rèn)為是一種注視。因此,該算法不適用于包含平滑追蹤眼球運(yùn)動的數(shù)據(jù)。
          開發(fā)者:Titus von der Malsburg
          最近更新時間:2015年10月
          獲取鏈接:https://cran.r-project.org/web/packages/saccades/
          https://github.com/tmalsburg/saccades

          1.36?scanpatterns
          用于分析掃描模式的 R 包
          開發(fā)者:Filip Dechterenko
          最近更新時間:2018年
          獲取鏈接:https://github.com/fidadoma/scanpatterns/

          1.37 ScaSim
          用于分析眼動掃描路徑模式的 R 包
          開發(fā)者:Titus von der Malsburg
          最近更新時間:2015年10月
          獲取鏈接:https://github.com/tmalsburg/scanpath

          1.38?SRSA
          用于二次表征掃描路徑分析的 R 包。
          開發(fā)者:Simon Kucharsky
          最近更新時間:2018年1月
          獲取鏈接:https://github.com/Kucharssim/SRSA

          1.39 tnt_pupilometry
          瞳孔測量的分析腳本和一些實(shí)用函數(shù)。
          開發(fā)者:Mike Lawrence
          最近更新時間:2017年8月
          獲取鏈接:https://github.com/mike-lawrence/tnt_pupilometry

          1.40 vwp
          用于注視數(shù)據(jù)預(yù)處理的 R 函數(shù)
          開發(fā)者:jacolien
          最近更新時間:2015年6月
          獲取鏈接:https://github.com/jacolien/vwp

          1.41?VWPre
          開發(fā)者:Vincent Porretta
          最近更新時間:2020年11月
          獲取鏈接:https://github.com/cran/VWPre
          https://cran.r-project.org/web/packages/VWPre/index.html
          文獻(xiàn)引用:Porretta, V., Kyr?l?inen, A. J., van Rij, J., & J?rvikivi, J. (2017, June). Visual world paradigm data: From preprocessing to nonlinear time-course analysis. In International Conference on Intelligent Decision Technologies (pp. 268-277). Springer, Cham.

          R語言眼動數(shù)據(jù)分析工具包篇,到這里就要結(jié)束了。
          參考資料:Researcher Contributed Eye Tracking Tools:https://github.com/davebraze/FDBeye/wiki/Researcher-Contributed-Eye-Tracking-Tools

          本文內(nèi)容來源以上網(wǎng)址及公眾號。以上內(nèi)容僅供學(xué)習(xí)使用,不作其它用途,如有侵權(quán),請留言聯(lián)系,作刪除處理!


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