高顏值在線繪圖平臺(tái)ImageGP系列教程 - 參數(shù)介紹
1.2?每個(gè)工具基本介紹
以熱圖為例,介紹下各個(gè)工具頁面的組成部分。
第一部分是輪播圖,展現(xiàn)每個(gè)工具能產(chǎn)生的代表性圖、示例數(shù)據(jù)和參數(shù);給定符合格式的數(shù)據(jù)、設(shè)置指定的參數(shù),即可獲得右側(cè)的可視化結(jié)果。
第二部分是引用信息。BIC?目前還是?Beta?版,尚未發(fā)表,其前身 ImageGP 已發(fā)表到 iMeta (https://doi.org/10.1002/imt2.5) 雜志,使用后請(qǐng)引用,支持工具的進(jìn)一步發(fā)展。
第三部分是 Demo 按鈕。通常 Demo 按鈕的數(shù)目和順序是跟輪播圖一致的,點(diǎn)擊 Demo 按鈕后,會(huì)填入相應(yīng)的數(shù)據(jù)、選擇相應(yīng)的參數(shù),直接點(diǎn)擊提交就可以獲得可視化結(jié)果。

第四部分是 Input data參數(shù)。支持直接粘貼矩陣到對(duì)應(yīng)的文本框 (不需要注冊(cè))或先注冊(cè)后上傳文件再選擇已上傳的文件 (適合數(shù)據(jù)比較大,直接粘貼進(jìn)來會(huì)把瀏覽器卡住的情形;或者多個(gè)工具都會(huì)用到的數(shù)據(jù),上傳一次多次使用)。


第五部分是 更多參數(shù)如 Cluster parameters, Data preprocess, Layout等。每個(gè)手風(fēng)琴里面有更多參數(shù)可以設(shè)置,如果該手風(fēng)琴里面有必選參數(shù),通常是打開的;如果沒有必選參數(shù),默認(rèn)是收起的。工具為了靈活性供更多人使用,參數(shù)比較多,但不是每次分析都會(huì)用到這么多參數(shù),常用的只有少部分。
第六部分是 Submit,提交。等待出結(jié)果。
第七部分是結(jié)果顯示,PNG 圖,PDF 圖,繪圖腳本,其它輔助數(shù)據(jù)。單純可視化的工具顯示簡單,分析的工具顯示復(fù)雜。

1.3?參數(shù)的控制
參數(shù)前面如果有一個(gè)紅色的星號(hào) (*)表示是必選或必填參數(shù)。如果必選或必填參數(shù)為空,則不能提交;或提交時(shí)也會(huì)彈出信息,不允許提交。
參數(shù)后面都有一個(gè)符號(hào) (i),鼠標(biāo)放上去后會(huì)懸浮顯示這個(gè)參數(shù)的解釋。這是了解這個(gè)參數(shù)的關(guān)鍵信息。
凡是有改動(dòng)的參數(shù),都會(huì)添加黃色背景以示區(qū)別。比如點(diǎn)擊 Demo后,會(huì)看的一些參數(shù)飄黃了,不要害怕,只是提示你 Demo 對(duì)這些參數(shù)做了修改。

參數(shù)的智能控制:
點(diǎn)擊
Check data之前,所有下方參數(shù)都不可用。需要先確保數(shù)據(jù)格式無誤、Check data?通過后,才可以選擇更多參數(shù)。點(diǎn)擊
Check data后,也會(huì)存在部分參數(shù)不可用的情況。這是因?yàn)閰?shù)之間存在著級(jí)聯(lián)控制。如熱圖聚類,如果沒有選要做聚類、則聚類方法、距離計(jì)算方法不可選,選了也沒用??吹揭粋€(gè)參數(shù)不可用,如果不知道是做啥的或用不到,就可以大膽的忽略。如果想用,卻發(fā)現(xiàn)用不了,就要找下其相關(guān)參數(shù)有沒有設(shè)置。部分參數(shù)為下拉,主要是選擇數(shù)據(jù)矩陣中的列名字、列的內(nèi)容時(shí)會(huì)用到。這樣一來可以避免輸入錯(cuò)誤,二來也給了一個(gè)提示這個(gè)參數(shù)應(yīng)該提供什么信息。
顏色參數(shù)之間存在互斥。選擇顏色集合和自定義取色兩個(gè)只有一個(gè)處于可選狀態(tài),清空一個(gè)選項(xiàng),另一個(gè)選項(xiàng)即可用。
1.4?數(shù)據(jù)格式效驗(yàn)
數(shù)據(jù)格式效驗(yàn)主要包括幾個(gè)內(nèi)容:
數(shù)據(jù)矩陣的列分割符是否為單個(gè)
TAB鍵。數(shù)據(jù)矩陣的每一行列數(shù)是否相等。這也是常見問題。
矩陣的列名字是否有特殊字符。
兩個(gè)數(shù)據(jù)矩陣的信息是否匹配。
寬矩陣是否第一列有無重復(fù)值、除了第一行和第一列其它元素是否都為數(shù)字。

檢測不通過的都會(huì)給出提示,請(qǐng)仔細(xì)閱讀提示信息,改正數(shù)據(jù)后再提交。
1.5?微信求助
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