用Python構(gòu)建和可視化決策樹
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本文轉(zhuǎn)載自:磐創(chuàng)AI
決策樹
決策樹是當(dāng)今最強(qiáng)大的監(jiān)督學(xué)習(xí)方法的組成部分。決策樹基本上是一個(gè)二叉樹的流程圖,其中每個(gè)節(jié)點(diǎn)根據(jù)某個(gè)特征變量將一組觀測值拆分。
決策樹的目標(biāo)是將數(shù)據(jù)分成多個(gè)組,這樣一個(gè)組中的每個(gè)元素都屬于同一個(gè)類別。決策樹也可以用來近似連續(xù)的目標(biāo)變量。在這種情況下,樹將進(jìn)行拆分,使每個(gè)組的均方誤差最小。
決策樹的一個(gè)重要特性是它們很容易被解釋。你根本不需要熟悉機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)就可以理解決策樹在做什么。決策樹圖很容易解釋。
利弊
決策樹方法的優(yōu)點(diǎn)是:
決策樹能夠生成可理解的規(guī)則。
決策樹在不需要大量計(jì)算的情況下進(jìn)行分類。
決策樹能夠處理連續(xù)變量和分類變量。
決策樹提供了一個(gè)明確的指示,哪些字段是最重要的。
決策樹方法的缺點(diǎn)是:
決策樹不太適合于目標(biāo)是預(yù)測連續(xù)屬性值的估計(jì)任務(wù)。
決策樹在類多、訓(xùn)練樣本少的分類問題中容易出錯(cuò)。
決策樹的訓(xùn)練在計(jì)算上可能很昂貴。生成決策樹的過程在計(jì)算上非常昂貴。在每個(gè)節(jié)點(diǎn)上,每個(gè)候選拆分字段都必須進(jìn)行排序,才能找到其最佳拆分。在某些算法中,使用字段組合,必須搜索最佳組合權(quán)重。剪枝算法也可能是昂貴的,因?yàn)樵S多候選子樹必須形成和比較。
Python決策樹
Python是一種通用編程語言,它為數(shù)據(jù)科學(xué)家提供了強(qiáng)大的機(jī)器學(xué)習(xí)包和工具。在本文中,我們將使用python最著名的機(jī)器學(xué)習(xí)包scikit-learn來構(gòu)建決策樹模型。我們將使用scikit learn提供的“DecisionTreeClassifier”算法創(chuàng)建模型,然后使用“plot_tree”函數(shù)可視化模型。
步驟1:導(dǎo)入包
我們構(gòu)建模型的主要軟件包是pandas、scikit learn和NumPy。按照代碼在python中導(dǎo)入所需的包。
import?pandas?as?pd?#?數(shù)據(jù)處理
import?numpy?as?np?#?使用數(shù)組
import?matplotlib.pyplot?as?plt?#?可視化
from?matplotlib?import?rcParams?#?圖大小
from?termcolor?import?colored?as?cl?#?文本自定義
from?sklearn.tree?import?DecisionTreeClassifier?as?dtc?#?樹算法
from?sklearn.model_selection?import?train_test_split?#?拆分?jǐn)?shù)據(jù)
from?sklearn.metrics?import?accuracy_score?#?模型準(zhǔn)確度
from?sklearn.tree?import?plot_tree?#?樹圖
rcParams['figure.figsize']?=?(25,?20)
在導(dǎo)入構(gòu)建我們的模型所需的所有包之后,是時(shí)候?qū)霐?shù)據(jù)并對其進(jìn)行一些EDA了。
步驟2:導(dǎo)入數(shù)據(jù)和EDA
在這一步中,我們將使用python中提供的“Pandas”包來導(dǎo)入并在其上進(jìn)行一些EDA。我們將建立我們的決策樹模型,數(shù)據(jù)集是一個(gè)藥物數(shù)據(jù)集,它是基于特定的標(biāo)準(zhǔn)給病人開的處方。讓我們用python導(dǎo)入數(shù)據(jù)!
Python實(shí)現(xiàn):
df?=?pd.read_csv('drug.csv')
df.drop('Unnamed:?0',?axis?=?1,?inplace?=?True)
print(cl(df.head(),?attrs?=?['bold']))
「輸出:」
???Age?Sex??????BP?Cholesterol??Na_to_K???Drug
0???23???F????HIGH????????HIGH???25.355??drugY
1???47???M?????LOW????????HIGH???13.093??drugC
2???47???M?????LOW????????HIGH???10.114??drugC
3???28???F??NORMAL????????HIGH????7.798??drugX
4???61???F?????LOW????????HIGH???18.043??drugY
現(xiàn)在我們對數(shù)據(jù)集有了一個(gè)清晰的概念。導(dǎo)入數(shù)據(jù)后,讓我們使用“info”函數(shù)獲取有關(guān)數(shù)據(jù)的一些基本信息。此函數(shù)提供的信息包括條目數(shù)、索引號、列名、非空值計(jì)數(shù)、屬性類型等。
Python實(shí)現(xiàn):
df.info()
「輸出:」
<class?'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex:?200?entries,?0?to?199
Data?columns?(total?6?columns):
?#???Column???????Non-Null?Count??Dtype??
---??------???????--------------??-----??
?0???Age??????????200?non-null????int64??
?1???Sex??????????200?non-null????object?
?2???BP???????????200?non-null????object?
?3???Cholesterol??200?non-null????object?
?4???Na_to_K??????200?non-null????float64
?5???Drug?????????200?non-null????object?
dtypes:?float64(1),?int64(1),?object(4)
memory?usage:?9.5+?KB
步驟3:數(shù)據(jù)處理
我們可以看到像Sex, BP和Cholesterol這樣的屬性在本質(zhì)上是分類的和對象類型的。問題是,scikit-learn中的決策樹算法本質(zhì)上不支持X變量(特征)是“對象”類型。因此,有必要將這些“object”值轉(zhuǎn)換為“binary”值。讓我們用python來實(shí)現(xiàn)
Python實(shí)現(xiàn):
for?i?in?df.Sex.values:
????if?i??==?'M':
????????df.Sex.replace(i,?0,?inplace?=?True)
????else:
????????df.Sex.replace(i,?1,?inplace?=?True)
for?i?in?df.BP.values:
????if?i?==?'LOW':
????????df.BP.replace(i,?0,?inplace?=?True)
????elif?i?==?'NORMAL':
????????df.BP.replace(i,?1,?inplace?=?True)
????elif?i?==?'HIGH':
????????df.BP.replace(i,?2,?inplace?=?True)
for?i?in?df.Cholesterol.values:
????if?i?==?'LOW':
????????df.Cholesterol.replace(i,?0,?inplace?=?True)
????else:
????????df.Cholesterol.replace(i,?1,?inplace?=?True)
print(cl(df,?attrs?=?['bold']))
「輸出:」
?????Age??Sex??BP??Cholesterol??Na_to_K???Drug
0?????23????1???2????????????1???25.355??drugY
1?????47????1???0????????????1???13.093??drugC
2?????47????1???0????????????1???10.114??drugC
3?????28????1???1????????????1????7.798??drugX
4?????61????1???0????????????1???18.043??drugY
..???...??...??..??????????...??????...????...
195???56????1???0????????????1???11.567??drugC
196???16????1???0????????????1???12.006??drugC
197???52????1???1????????????1????9.894??drugX
198???23????1???1????????????1???14.020??drugX
199???40????1???0????????????1???11.349??drugX
[200?rows?x?6?columns]
我們可以觀察到所有的“object”值都被處理成“binary”值來表示分類數(shù)據(jù)。例如,在膽固醇屬性中,顯示“低”的值被處理為0,“高”則被處理為1?,F(xiàn)在我們準(zhǔn)備好從數(shù)據(jù)中創(chuàng)建因變量和自變量。
步驟4:拆分?jǐn)?shù)據(jù)
在將我們的數(shù)據(jù)處理為正確的結(jié)構(gòu)之后,我們現(xiàn)在設(shè)置“X”變量(自變量),“Y”變量(因變量)。讓我們用python來實(shí)現(xiàn)
Python實(shí)現(xiàn):
X_var?=?df[['Sex',?'BP',?'Age',?'Cholesterol',?'Na_to_K']].values?#?自變量
y_var?=?df['Drug'].values?#?因變量
print(cl('X?variable?samples?:?{}'.format(X_var[:5]),?attrs?=?['bold']))
print(cl('Y?variable?samples?:?{}'.format(y_var[:5]),?attrs?=?['bold']))
「輸出:」
X?variable?samples?:?[[?1.?????2.????23.?????1.????25.355]
?[?1.?????0.????47.?????1.????13.093]
?[?1.?????0.????47.?????1.????10.114]
?[?1.?????1.????28.?????1.?????7.798]
?[?1.?????0.????61.?????1.????18.043]]
Y?variable?samples?:?['drugY'?'drugC'?'drugC'?'drugX'?'drugY']
我們現(xiàn)在可以使用scikit learn中的“train_test_split”算法將數(shù)據(jù)分成訓(xùn)練集和測試集,其中包含我們定義的X和Y變量。按照代碼在python中拆分?jǐn)?shù)據(jù)。
Python實(shí)現(xiàn):
X_train,?X_test,?y_train,?y_test?=?train_test_split(X_var,?y_var,?test_size?=?0.2,?random_state?=?0)
print(cl('X_train?shape?:?{}'.format(X_train.shape),?attrs?=?['bold'],?color?=?'black'))
print(cl('X_test?shape?:?{}'.format(X_test.shape),?attrs?=?['bold'],?color?=?'black'))
print(cl('y_train?shape?:?{}'.format(y_train.shape),?attrs?=?['bold'],?color?=?'black'))
print(cl('y_test?shape?:?{}'.format(y_test.shape),?attrs?=?['bold'],?color?=?'black'))
「輸出:」
X_train?shape?:?(160,?5)
X_test?shape?:?(40,?5)
y_train?shape?:?(160,)
y_test?shape?:?(40,)
現(xiàn)在我們有了構(gòu)建決策樹模型的所有組件。所以,讓我們繼續(xù)用python構(gòu)建我們的模型。
步驟5:建立模型和預(yù)測
在scikit學(xué)習(xí)包提供的“DecisionTreeClassifier”算法的幫助下,構(gòu)建決策樹是可行的。之后,我們可以使用我們訓(xùn)練過的模型來預(yù)測我們的數(shù)據(jù)。最后,我們的預(yù)測結(jié)果的精度可以用“準(zhǔn)確度”評估指標(biāo)來計(jì)算。讓我們用python來完成這個(gè)過程!
Python實(shí)現(xiàn):
model?=?dtc(criterion?=?'entropy',?max_depth?=?4)
model.fit(X_train,?y_train)
pred_model?=?model.predict(X_test)
print(cl('Accuracy?of?the?model?is?{:.0%}'.format(accuracy_score(y_test,?pred_model)),?attrs?=?['bold']))
「輸出:」
Accuracy?of?the?model?is?88%
在代碼的第一步中,我們定義了一個(gè)名為“model”變量的變量,我們在其中存儲DecisionTreeClassifier模型。接下來,我們將使用我們的訓(xùn)練集對模型進(jìn)行擬合和訓(xùn)練。之后,我們定義了一個(gè)變量,稱為“pred_model”變量,其中我們將模型預(yù)測的所有值存儲在數(shù)據(jù)上。最后,我們計(jì)算了我們的預(yù)測值與實(shí)際值的精度,其準(zhǔn)確率為88%。
步驟6:可視化模型
現(xiàn)在我們有了決策樹模型,讓我們利用python中scikit learn包提供的“plot_tree”函數(shù)來可視化它。按照代碼從python中的決策樹模型生成一個(gè)漂亮的樹圖。
Python實(shí)現(xiàn):
feature_names?=?df.columns[:5]
target_names?=?df['Drug'].unique().tolist()
plot_tree(model,?
??????????feature_names?=?feature_names,?
??????????class_names?=?target_names,?
??????????filled?=?True,?
??????????rounded?=?True)
plt.savefig('tree_visualization.png')?
「輸出:」

結(jié)論
有很多技術(shù)和其他算法用于優(yōu)化決策樹和避免過擬合,比如剪枝。雖然決策樹通常是不穩(wěn)定的,這意味著數(shù)據(jù)的微小變化會導(dǎo)致最優(yōu)樹結(jié)構(gòu)的巨大變化,但其簡單性使其成為廣泛應(yīng)用的有力候選。在神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)流行之前,決策樹是機(jī)器學(xué)習(xí)中最先進(jìn)的算法。其他一些集成模型,比如隨機(jī)森林模型,比普通決策樹模型更強(qiáng)大。
決策樹由于其簡單性和可解釋性而非常強(qiáng)大。決策樹和隨機(jī)森林在用戶注冊建模、信用評分、故障預(yù)測、醫(yī)療診斷等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。我為本文提供了完整的代碼。
完整代碼:
import?pandas?as?pd?#?數(shù)據(jù)處理
import?numpy?as?np?#?使用數(shù)組
import?matplotlib.pyplot?as?plt?#?可視化
from?matplotlib?import?rcParams?#?圖大小
from?termcolor?import?colored?as?cl?#?文本自定義
from?sklearn.tree?import?DecisionTreeClassifier?as?dtc?#?樹算法
from?sklearn.model_selection?import?train_test_split?#?拆分?jǐn)?shù)據(jù)
from?sklearn.metrics?import?accuracy_score?#?模型準(zhǔn)確度
from?sklearn.tree?import?plot_tree?#?樹圖
rcParams['figure.figsize']?=?(25,?20)
df?=?pd.read_csv('drug.csv')
df.drop('Unnamed:?0',?axis?=?1,?inplace?=?True)
print(cl(df.head(),?attrs?=?['bold']))
df.info()
for?i?in?df.Sex.values:
????if?i??==?'M':
????????df.Sex.replace(i,?0,?inplace?=?True)
????else:
????????df.Sex.replace(i,?1,?inplace?=?True)
????????
for?i?in?df.BP.values:
????if?i?==?'LOW':
????????df.BP.replace(i,?0,?inplace?=?True)
????elif?i?==?'NORMAL':
????????df.BP.replace(i,?1,?inplace?=?True)
????elif?i?==?'HIGH':
????????df.BP.replace(i,?2,?inplace?=?True)
????????
for?i?in?df.Cholesterol.values:
????if?i?==?'LOW':
????????df.Cholesterol.replace(i,?0,?inplace?=?True)
????else:
????????df.Cholesterol.replace(i,?1,?inplace?=?True)
????????
print(cl(df,?attrs?=?['bold']))
X_var?=?df[['Sex',?'BP',?'Age',?'Cholesterol',?'Na_to_K']].values?#?自變量
y_var?=?df['Drug'].values?#?因變量
print(cl('X?variable?samples?:?{}'.format(X_var[:5]),?attrs?=?['bold']))
print(cl('Y?variable?samples?:?{}'.format(y_var[:5]),?attrs?=?['bold']))
X_train,?X_test,?y_train,?y_test?=?train_test_split(X_var,?y_var,?test_size?=?0.2,?random_state?=?0)
print(cl('X_train?shape?:?{}'.format(X_train.shape),?attrs?=?['bold'],?color?=?'red'))
print(cl('X_test?shape?:?{}'.format(X_test.shape),?attrs?=?['bold'],?color?=?'red'))
print(cl('y_train?shape?:?{}'.format(y_train.shape),?attrs?=?['bold'],?color?=?'green'))
print(cl('y_test?shape?:?{}'.format(y_test.shape),?attrs?=?['bold'],?color?=?'green'))
model?=?dtc(criterion?=?'entropy',?max_depth?=?4)
model.fit(X_train,?y_train)
pred_model?=?model.predict(X_test)
print(cl('Accuracy?of?the?model?is?{:.0%}'.format(accuracy_score(y_test,?pred_model)),?attrs?=?['bold']))
feature_names?=?df.columns[:5]
target_names?=?df['Drug'].unique().tolist()
plot_tree(model,?
??????????feature_names?=?feature_names,?
??????????class_names?=?target_names,?
??????????filled?=?True,?
??????????rounded?=?True)
plt.savefig('tree_visualization.png')
原文鏈接:https://towardsdatascience.com/building-and-visualizing-decision-tree-in-python-2cfaafd8e1bb
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