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          kaggle圖像分割實(shí)戰(zhàn)要點(diǎn)與技巧總結(jié)

          共 11492字,需瀏覽 23分鐘

           ·

          2023-08-17 04:48

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          重磅干貨,第一時(shí)間送達(dá)

          編者薦語(yǔ)

           

          作者參加了39個(gè)Kaggle比賽,總結(jié)了非常多的技巧和經(jīng)驗(yàn),現(xiàn)在全部分享給大家。

          轉(zhuǎn)載自丨新機(jī)器視覺(jué)


          想象一下,如果你能得到所有的tips和tricks,你需要去參加一個(gè)Kaggle比賽。我已經(jīng)超過(guò)39個(gè)Kaggle比賽,包括:

          • Data Science Bowl 2017 – $1,000,000
          • Intel & MobileODT Cervical Cancer Screening – $100,000
          • 2018 Data Science Bowl – $100,000
          • Airbus Ship Detection Challenge – $60,000
          • Planet: Understanding the Amazon from Space – $60,000
          • APTOS 2019 Blindness Detection – $50,000
          • Human Protein Atlas Image Classification – $37,000
          • SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation – $30,000
          • Inclusive Images Challenge – $25,000

          現(xiàn)在把這些知識(shí)都挖出來(lái)給你們!


          外部數(shù)據(jù)


          • 使用 LUng Node Analysis Grand Challenge 數(shù)據(jù),因?yàn)檫@個(gè)數(shù)據(jù)集包含了來(lái)自放射學(xué)的標(biāo)注細(xì)節(jié)。
          • 使用 LIDC-IDRI 數(shù)據(jù),因?yàn)樗哂姓业搅四[瘤的所有放射學(xué)的描述。
          • 使用Flickr CC,維基百科通用數(shù)據(jù)集
          • 使用Human Protein Atlas Dataset
          • 使用IDRiD數(shù)據(jù)集

          數(shù)據(jù)探索和直覺(jué)


          • 使用0.5的閾值對(duì)3D分割進(jìn)行聚類
          • 確認(rèn)在訓(xùn)練集和測(cè)試集的標(biāo)簽分布上有沒(méi)有不一樣的地方


          預(yù)處理


          • 使用DoG(Difference of Gaussian)方法進(jìn)行blob檢測(cè),使用skimage中的方法。
          • 使用基于patch的輸入進(jìn)行訓(xùn)練,為了減少訓(xùn)練時(shí)間。
          • 使用cudf加載數(shù)據(jù),不要用Pandas,因?yàn)樽x數(shù)據(jù)更快。
          • 確保所有的圖像具有相同的方向。
          • 在進(jìn)行直方圖均衡化的時(shí)候,使用對(duì)比度限制。
          • 使用OpenCV進(jìn)行通用的圖像預(yù)處理。
          • 使用自動(dòng)化主動(dòng)學(xué)習(xí),添加手工標(biāo)注。
          • 將所有的圖像縮放成相同的分辨率,可以使用相同的模型來(lái)掃描不同的厚度。
          • 將掃描圖像歸一化為3D的numpy數(shù)組。
          • 對(duì)單張圖像使用暗通道先驗(yàn)方法進(jìn)行圖像去霧。
          • 將所有圖像轉(zhuǎn)化成Hounsfield單位(放射學(xué)中的概念)。
          • 使用RGBY的匹配系數(shù)來(lái)找到冗余的圖像。
          • 開(kāi)發(fā)一個(gè)采樣器,讓標(biāo)簽更加的均衡。
          • 對(duì)測(cè)試圖像打偽標(biāo)簽來(lái)提升分?jǐn)?shù)。
          • 將圖像/Mask降采樣到320x480。
          • 直方圖均衡化(CLAHE)的時(shí)候使用kernel size為32×32
          • 將DCM轉(zhuǎn)化為PNG。
          • 當(dāng)有冗余圖像的時(shí)候,為每個(gè)圖像計(jì)算md5 hash值。


          數(shù)據(jù)增強(qiáng)


          • 使用 albumentations 進(jìn)行數(shù)據(jù)增強(qiáng)。
          • 使用隨機(jī)90度旋轉(zhuǎn)。
          • 使用水平翻轉(zhuǎn),上下翻轉(zhuǎn)。
          • 可以嘗試較大的幾何變換:彈性變換,仿射變換,樣條仿射變換,枕形畸變。
          • 使用隨機(jī)HSV。
          • 使用loss-less增強(qiáng)來(lái)進(jìn)行泛化,防止有用的圖像信息出現(xiàn)大的loss。
          • 應(yīng)用channel shuffling
          • 基于類別的頻率進(jìn)行數(shù)據(jù)增強(qiáng)。
          • 使用高斯噪聲。
          • 對(duì)3D圖像使用lossless重排來(lái)進(jìn)行數(shù)據(jù)增強(qiáng)。
          • 0到45度隨機(jī)旋轉(zhuǎn)。
          • 從0.8到1.2隨機(jī)縮放。
          • 亮度變換。
          • 隨機(jī)變化hue和飽和度。
          • 使用D4:https://en.wikipedia.org/wiki/Dihedral_group增強(qiáng)。
          • 在進(jìn)行直方圖均衡化的時(shí)候使用對(duì)比度限制。
          • 使用AutoAugment:https://arxiv.org/pdf/1805.09501.pdf增強(qiáng)策略。


          模型

          結(jié)構(gòu)

          • 使用U-net作為基礎(chǔ)結(jié)構(gòu),并調(diào)整以適應(yīng)3D的輸入。
          • 使用自動(dòng)化主動(dòng)學(xué)習(xí)并添加人工標(biāo)注。
          • 使用inception-ResNet v2 architecture結(jié)構(gòu)使用不同的感受野訓(xùn)練特征。
          • 使用Siamese networks進(jìn)行對(duì)抗訓(xùn)練。
          • 使用ResNet50XceptionInception ResNet v2 x 5,最后一層用全連接。
          • 使用global max-pooling layer,無(wú)論什么輸入尺寸,返回固定長(zhǎng)度的輸出。
          • 使用stacked dilated convolutions。
          • VoxelNet。
          • 在LinkNet的跳躍連接中將相加替換為拼接和conv1x1。
          • Generalized mean pooling。
          • 使用224x224x3的輸入,用Keras NASNetLarge從頭訓(xùn)練模型。
          • 使用3D卷積網(wǎng)絡(luò)。
          • 使用ResNet152作為預(yù)訓(xùn)練的特征提取器。
          • 將ResNet的最后的全連接層替換為3個(gè)使用dropout的全連接層。
          • 在decoder中使用轉(zhuǎn)置卷積。
          • 使用VGG作為基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)。
          • 使用C3D網(wǎng)絡(luò),使用adjusted receptive fields,在網(wǎng)絡(luò)的最后使用64 unit bottleneck layer 。
          • 使用帶預(yù)訓(xùn)練權(quán)重的UNet類型的結(jié)構(gòu)在8bit RGB輸入圖像上提升收斂性和二元分割的性能。
          • 使用LinkNet,因?yàn)橛挚煊质?nèi)存。
          • MASKRCNN
          • BN-Inception
          • Fast Point R-CNN
          • Seresnext
          • UNet and Deeplabv3
          • Faster RCNN
          • SENet154
          • ResNet152
          • NASNet-A-Large
          • EfficientNetB4
          • ResNet101
          • GAPNet
          • PNASNet-5-Large
          • Densenet121
          • AC-GAN
          • XceptionNet (96), XceptionNet (299), Inception v3 (139), InceptionResNet v2 (299), DenseNet121 (224)
          • AlbuNet (resnet34) from ternausnets
          • SpaceNet
          • Resnet50 from selim_sef SpaceNet 4
          • SCSEUnet (seresnext50) from selim_sef SpaceNet 4
          • A custom Unet and Linknet architecture
          • FPNetResNet50 (5 folds)
          • FPNetResNet101 (5 folds)
          • FPNetResNet101 (7 folds with different seeds)
          • PANetDilatedResNet34 (4 folds)
          • PANetResNet50 (4 folds)
          • EMANetResNet101 (2 folds)
          • RetinaNet
          • Deformable R-FCN
          • Deformable Relation Networks


          硬件設(shè)置


          • Use of the AWS GPU instance p2.xlarge with a NVIDIA K80 GPU
          • Pascal Titan-X GPU
          • Use of 8 TITAN X GPUs
          • 6 GPUs: 21080Ti + 41080
          • Server with 8×NVIDIA Tesla P40, 256 GB RAM and 28 CPU cores
          • Intel Core i7 5930k, 2×1080, 64 GB of RAM, 2x512GB SSD, 3TB HDD
          • GCP 1x P100, 8x CPU, 15 GB RAM, SSD or 2x P100, 16x CPU, 30 GB RAM
          • NVIDIA Tesla P100 GPU with 16GB of RAM
          • Intel Core i7 5930k, 2×1080, 64 GB of RAM, 2x512GB SSD, 3TB HDD
          • 980Ti GPU, 2600k CPU, and 14GB RAM


          損失函數(shù)


          • Dice Coefficient ,因?yàn)樵诓痪鈹?shù)據(jù)上工作很好。
          • Weighted boundary loss 目的是減少預(yù)測(cè)的分割和ground truth之間的距離。
          • MultiLabelSoftMarginLoss 使用one-versus-all損失優(yōu)化多標(biāo)簽。
          • Balanced cross entropy (BCE) with logit loss 通過(guò)系數(shù)來(lái)分配正負(fù)樣本的權(quán)重。
          • Lovasz 基于sub-modular損失的convex Lovasz擴(kuò)展來(lái)直接優(yōu)化平均IoU損失。
          • FocalLoss + Lovasz 將Focal loss和Lovasz losses相加得到。
          • Arc margin loss 通過(guò)添加margin來(lái)最大化人臉類別的可分性。
          • Npairs loss 計(jì)算y_true 和 y_pred之間的npairs損失。
          • 將BCE和Dice loss組合起來(lái)。
          • LSEP – 一種成對(duì)的排序損失,處處平滑因此容易優(yōu)化。
          • Center loss 同時(shí)學(xué)習(xí)每個(gè)類別的特征中心,并對(duì)距離特征中心距離太遠(yuǎn)的樣本進(jìn)行懲罰。
          • Ring Loss 對(duì)標(biāo)準(zhǔn)的損失函數(shù)進(jìn)行了增強(qiáng),如Softmax。
          • Hard triplet loss 訓(xùn)練網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行特征嵌入,最大化不同類別之間的特征的距離。
          • 1 + BCE – Dice 包含了BCE和DICE損失再加1。
          • Binary cross-entropy – ?log(dice) 二元交叉熵減去dice loss的log。
          • BCE, dice和focal 損失的組合。
          • BCE + DICE - Dice損失通過(guò)計(jì)算平滑的dice系數(shù)得到。
          • Focal loss with Gamma 2 標(biāo)準(zhǔn)交叉熵?fù)p失的升級(jí)。
          • BCE + DICE + Focal – 3種損失相加。
          • Active Contour Loss 加入了面積和尺寸信息,并集成到深度學(xué)習(xí)模型中。
          • 1024 * BCE(results, masks) + BCE(cls, cls_target)
          • Focal + kappa – Kappa是一種用于多類別分類的損失,這里和Focal loss相加。
          • ArcFaceLoss?—? 用于人臉識(shí)別的Additive Angular Margin Loss。
          • soft Dice trained on positives only – 使用預(yù)測(cè)概率的Soft Dice。
          • 2.7 * BCE(pred_mask, gt_mask) + 0.9 * DICE(pred_mask, gt_mask) + 0.1 * BCE(pred_empty, gt_empty) 一種自定義損失。
          • nn.SmoothL1Loss()
          • 使用Mean Squared Error objective function,在某些場(chǎng)景下比二元交叉熵?fù)p失好。


          訓(xùn)練技巧


          • 嘗試不同的學(xué)習(xí)率。
          • 嘗試不同的batch size。
          • 使用SGD + 動(dòng)量 并手工設(shè)計(jì)學(xué)習(xí)率策略。
          • 太多的增強(qiáng)會(huì)降低準(zhǔn)確率。
          • 在圖像上進(jìn)行裁剪做訓(xùn)練,全尺寸圖像做預(yù)測(cè)。
          • 使用Keras的ReduceLROnPlateau()作為學(xué)習(xí)率策略。
          • 不使用數(shù)據(jù)增強(qiáng)訓(xùn)練到平臺(tái)期,然后對(duì)一些epochs使用軟硬增強(qiáng)。
          • 凍結(jié)除了最后一層外的所有層,使用1000張圖像進(jìn)行微調(diào),作為第一步。
          • 使用分類別采樣
          • 在調(diào)試最后一層的時(shí)候使用dropout和增強(qiáng)
          • 使用偽標(biāo)簽來(lái)提高分?jǐn)?shù)
          • 使用Adam在plateau的時(shí)候衰減學(xué)習(xí)率
          • 用SGD使用Cyclic學(xué)習(xí)率策略
          • 如果驗(yàn)證損失持續(xù)2個(gè)epochs沒(méi)有降低,將學(xué)習(xí)率進(jìn)行衰減
          • 將10個(gè)batches里的最差的batch進(jìn)行重復(fù)訓(xùn)練
          • 使用默認(rèn)的UNET進(jìn)行訓(xùn)練
          • 對(duì)patch進(jìn)行重疊,這樣邊緣像素被覆蓋兩次
          • 超參數(shù)調(diào)試:訓(xùn)練時(shí)候的學(xué)習(xí)率,非極大值抑制以及推理時(shí)候的分?jǐn)?shù)閾值
          • 將低置信度得分的包圍框去掉。
          • 訓(xùn)練不同的卷積網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行模型集成。
          • 在F1score開(kāi)始下降的時(shí)候就停止訓(xùn)練。
          • 使用不同的學(xué)習(xí)率。
          • 使用層疊的方法用5 folds的方法訓(xùn)練ANN,重復(fù)30次。


          評(píng)估和驗(yàn)證


          • 按類別非均勻的劃分訓(xùn)練和測(cè)試集
          • 當(dāng)調(diào)試最后一層的時(shí)候,使用交叉驗(yàn)證來(lái)避免過(guò)擬合。
          • 使用10折交叉驗(yàn)證集成來(lái)進(jìn)行分類。
          • 檢測(cè)的時(shí)候使用5-10折交叉驗(yàn)證來(lái)集成。


          集成方法


          • 使用簡(jiǎn)單的投票方法進(jìn)行集成
          • 對(duì)于類別很多的模型使用LightGBM,使用原始特征。
          • 對(duì)2層模型使用CatBoost
          • 使用 ‘curriculum learning’ 來(lái)加速模型訓(xùn)練,這種訓(xùn)練模式下,模型先在簡(jiǎn)單樣本上訓(xùn)練,再在困難樣本上訓(xùn)練。
          • 使用ResNet50, InceptionV3, and InceptionResNetV2進(jìn)行集成。
          • 對(duì)物體檢測(cè)使用集成。
          • 對(duì)Mask RCNNYOLOv3, 和Faster RCNN 進(jìn)行集成。


          后處理


          • 使用test time augmentation?,對(duì)一張圖像進(jìn)行隨機(jī)變換多次測(cè)試后對(duì)結(jié)果進(jìn)行平均。
          • 對(duì)測(cè)試的預(yù)測(cè)概率進(jìn)行均衡化,而不是使用預(yù)測(cè)的類別。
          • 對(duì)預(yù)測(cè)結(jié)果進(jìn)行幾何平均。
          • 在推理的時(shí)候分塊重疊,因?yàn)閁Net對(duì)邊緣區(qū)域的預(yù)測(cè)不是很好。
          • 進(jìn)行非極大值抑制和包圍框的收縮。
          • 在實(shí)例分割中使用分水嶺算法后處理來(lái)分離物體。
              
          下載1:OpenCV-Contrib擴(kuò)展模塊中文版教程
          在「小白學(xué)視覺(jué)」公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù):擴(kuò)展模塊中文教程即可下載全網(wǎng)第一份OpenCV擴(kuò)展模塊教程中文版,涵蓋擴(kuò)展模塊安裝、SFM算法、立體視覺(jué)、目標(biāo)跟蹤、生物視覺(jué)、超分辨率處理等二十多章內(nèi)容。

          下載2:Python視覺(jué)實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目52講
          小白學(xué)視覺(jué)公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù):Python視覺(jué)實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目即可下載包括圖像分割、口罩檢測(cè)、車道線檢測(cè)、車輛計(jì)數(shù)、添加眼線、車牌識(shí)別、字符識(shí)別、情緒檢測(cè)、文本內(nèi)容提取、面部識(shí)別等31個(gè)視覺(jué)實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目,助力快速學(xué)校計(jì)算機(jī)視覺(jué)。

          下載3:OpenCV實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目20講
          小白學(xué)視覺(jué)公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù):OpenCV實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目20講即可下載含有20個(gè)基于OpenCV實(shí)現(xiàn)20個(gè)實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目,實(shí)現(xiàn)OpenCV學(xué)習(xí)進(jìn)階。

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          歡迎加入公眾號(hào)讀者群一起和同行交流,目前有SLAM、三維視覺(jué)、傳感器自動(dòng)駕駛、計(jì)算攝影、檢測(cè)、分割、識(shí)別、醫(yī)學(xué)影像、GAN算法競(jìng)賽等微信群(以后會(huì)逐漸細(xì)分),請(qǐng)掃描下面微信號(hào)加群,備注:”昵稱+學(xué)校/公司+研究方向“,例如:”張三 + 上海交大 + 視覺(jué)SLAM“。請(qǐng)按照格式備注,否則不予通過(guò)。添加成功后會(huì)根據(jù)研究方向邀請(qǐng)進(jìn)入相關(guān)微信群。請(qǐng)勿在群內(nèi)發(fā)送廣告,否則會(huì)請(qǐng)出群,謝謝理解~


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