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          生物計算黑科技:AI助力RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測

          共 1399字,需瀏覽 3分鐘

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          2021-03-03 10:32



          在生物學研究領(lǐng)域,傳統(tǒng)基于分子、細胞、生理學等傳統(tǒng)實驗方法很依賴于不斷的試錯和積累,不僅耗資巨大,周期往往也很長。

          隨著人工智能時代的到來,深度學習、大數(shù)據(jù)等創(chuàng)新手段,為生物學研究打開了另一扇窗。

          早在2018年4月,百度研究院就開始在計算生物學,尤其是 RNA 結(jié)構(gòu)預(yù)測這個研究領(lǐng)域開始發(fā)力,并在2019年發(fā)表了第一個重磅成果:快速 RNA 結(jié)構(gòu)預(yù)測算法 LinearFold。


          而2020年,一場突如其來的新冠疫情讓生物學與 AI 等技術(shù)的融合進一步加速。百度研究院利用 LinearFold 進行新冠全基因組結(jié)構(gòu)分析,縮小了分析時間,并提升精度。而另一個 mRNA 疫苗基因序列設(shè)計算法:LinearDesign,最快能11分鐘完成 mRNA 疫苗序列設(shè)計,大大提高了新冠疫苗穩(wěn)定性和蛋白質(zhì)表達水平。

          那么,用 AI 預(yù)測 RNA 二級結(jié)構(gòu)的生物學原理是什么?相關(guān)預(yù)測算法如何實現(xiàn)呢?

          本周三飛槳開發(fā)者說,我們邀請了百度美研深度學習實驗室, 計算生物學 Tech Lead 張賀,分享如何基于深度學習預(yù)測 RNA 二級結(jié)構(gòu),并會帶來相關(guān)賽事的題目解讀和基線模型介紹,對生物計算感興趣的同學,千萬不要錯過唷。

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          螺旋槳RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽

          本賽題旨在解決RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測的世界級難題,要求參賽選手基于百度發(fā)布的世界上最快的RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測算法LinearFold和世界上最快的RNA配分方程算法LinearPartition,預(yù)測給定RNA序列在每個位點上保持不成對的概率。對改比賽感興趣的朋友,點擊下方鏈接了解更多詳情:https://mp.weixin.qq.com/s/xk4Ka7xxnLK7mOqJ-7vfvQ



           飛槳開發(fā)者說 Live 

          每周三晚上 19:00-20:00,都有飛槳開發(fā)者技術(shù)專家(PPDE)或飛槳社區(qū)開發(fā)者在 B 站與大家見面交流。錯過了往期直播的小伙伴,可以到 B 站搜索飛槳 PaddlePaddle 回顧之前的直播喲。


           飛槳開發(fā)者技術(shù)專家(PPDE)

          飛槳開發(fā)者技術(shù)專家(PPDE)是百度飛槳對開發(fā)者的榮譽認證體系,成為其中的一員后,除了有專屬的 PPDE 系列活動外,還將享有從技術(shù)專家認證、頂級峰會交流與演講邀約,到全球技術(shù)游學、PPDE 專項贊助等豐富權(quán)益。
           
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