數(shù)據(jù)分析之正態(tài)分布檢驗及python實現(xiàn)
正態(tài)分布(Normal distribution),也稱“常態(tài)分布”,又名高斯分布(Gaussian distribution),最早由A.棣莫弗在求二項分布的漸近公式中得到。C.F.高斯在研究測量誤差時從另一個角度導(dǎo)出了它。P.S.拉普拉斯和高斯研究了它的性質(zhì)。是一個在數(shù)學(xué)、物理及工程等領(lǐng)域都非常重要的概率分布,在統(tǒng)計學(xué)的許多方面有著重大的影響力。
正態(tài)曲線呈鐘型,兩頭低,中間高,左右對稱因其曲線呈鐘形,因此人們又經(jīng)常稱之為鐘形曲線。
正太性檢驗
利用觀測數(shù)據(jù)判斷總體是否服從正態(tài)分布的檢驗稱為正態(tài)性檢驗,它是統(tǒng)計判決中重要的一種特殊的擬合優(yōu)度假設(shè)檢驗。
直方圖初判 / QQ圖判斷 / K-S檢驗
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
% matplotlib inline
直方圖初判
s = pd.DataFrame(np.random.randn(1000)+10,columns = ['value'])
print(s.head())
# 創(chuàng)建隨機數(shù)據(jù)
fig = plt.figure(figsize = (10,6))
ax1 = fig.add_subplot(2,1,1) # 創(chuàng)建子圖1
ax1.scatter(s.index, s.values)
plt.grid()
# 繪制數(shù)據(jù)分布圖
ax2 = fig.add_subplot(2,1,2) # 創(chuàng)建子圖2
s.hist(bins=30,alpha = 0.5,ax = ax2)
s.plot(kind = 'kde', secondary_y=True,ax = ax2)
plt.grid()
# 繪制直方圖
# 呈現(xiàn)較明顯的正太性
這里的直方圖呈現(xiàn)出非常明顯的正態(tài)分布特性。
QQ圖判斷
# QQ圖通過把測試樣本數(shù)據(jù)的分位數(shù)與已知分布相比較,從而來檢驗數(shù)據(jù)的分布情況
# QQ圖是一種散點圖,對應(yīng)于正態(tài)分布的QQ圖,就是由標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布的分位數(shù)為橫坐標(biāo),樣本值為縱坐標(biāo)的散點圖
# 參考直線:四分之一分位點和四分之三分位點這兩點確定,看散點是否落在這條線的附近
# 繪制思路
# ① 在做好數(shù)據(jù)清洗后,對數(shù)據(jù)進行排序(次序統(tǒng)計量:x(1)<x(2)<....<x(n))
# ② 排序后,計算出每個數(shù)據(jù)對應(yīng)的百分位p{i},即第i個數(shù)據(jù)x(i)為p(i)分位數(shù),其中p(i)=(i-0.5)/n (pi有多重算法,這里以最常用方法為主)
# ③ 繪制直方圖 + qq圖,直方圖作為參考
s = pd.DataFrame(np.random.randn(1000)+10,columns = ['value'])
print(s.head())
# 創(chuàng)建隨機數(shù)據(jù)
mean = s['value'].mean()
std = s['value'].std()
print('均值為:%.2f,標(biāo)準(zhǔn)差為:%.2f' % (mean,std))
print('------')
# 計算均值,標(biāo)準(zhǔn)差
s.sort_values(by = 'value', inplace = True) # 重新排序
print(s.head())
s_r = s.reset_index(drop = False) # 重新排序后,更新index
print("----------\n", s_r.head())
s_r['p'] = (s_r.index - 0.5) / len(s_r)
s_r['q'] = (s_r['value'] - mean) / std
print(s_r.head())
print('------')
# 計算百分位數(shù) p(i)
# 計算q值
# st = s['value'].describe()
# x1 ,y1 = 0.25, st['25%']
# x2 ,y2 = 0.75, st['75%']
# print('四分之一位數(shù)為:%.2f,四分之三位數(shù)為:%.2f' % (y1,y2))
# print('------')
# # 計算四分之一位數(shù)、四分之三位數(shù)
# fig = plt.figure(figsize = (10,9))
# ax1 = fig.add_subplot(3,1,1) # 創(chuàng)建子圖1
# ax1.scatter(s.index, s.values)
# plt.grid()
# # 繪制數(shù)據(jù)分布圖
# ax2 = fig.add_subplot(3,1,2) # 創(chuàng)建子圖2
# s.hist(bins=30,alpha = 0.5,ax = ax2)
# s.plot(kind = 'kde', secondary_y=True,ax = ax2)
# plt.grid()
# # 繪制直方圖
# ax3 = fig.add_subplot(3,1,3) # 創(chuàng)建子圖3
# ax3.plot(s_r['p'],s_r['value'],'k.',alpha = 0.1)
# ax3.plot([x1,x2],[y1,y2],'-r')
# plt.grid()
# # 繪制QQ圖,直線為四分之一位數(shù)、四分之三位數(shù)的連線,基本符合正態(tài)分布
KS檢驗,理論推導(dǎo)
使用K-S檢驗一個數(shù)列是否服從正態(tài)分布、兩個數(shù)列是否服從相同的分布
使用K-S檢驗一個數(shù)列是否服從正態(tài)分布、兩個數(shù)列是否服從相同的分布 data = [87,77,92,68,80,78,84,77,81,80,80,77,92,86, 76,80,81,75,77,72,81,72,84,86,80,68,77,87, 76,77,78,92,75,80,78] # 樣本數(shù)據(jù),35位健康男性在未進食之前的血糖濃度
df = pd.DataFrame(data, columns =['value'])
u = df['value'].mean()
std = df['value'].std()
print("樣本均值為:%.2f,樣本標(biāo)準(zhǔn)差為:%.2f" % (u,std))
print('------')
# 查看數(shù)據(jù)基本統(tǒng)計量
s = df['value'].value_counts().sort_index()
df_s = pd.DataFrame({'血糖濃度':s.index,'次數(shù)':s.values})
# 創(chuàng)建頻率數(shù)據(jù)
df_s['累計次數(shù)'] = df_s['次數(shù)'].cumsum()
df_s['累計頻率'] = df_s['累計次數(shù)'] / len(data)
# len(data)
df_s['標(biāo)準(zhǔn)化取值'] = (df_s['血糖濃度'] - u) / std
df_s['理論分布'] =[0.0244,0.0968,0.2148,0.2643,0.3228,0.3859,0.5160,0.5832,0.7611,0.8531,0.8888,0.9803] # 通過查閱正太分布表
df_s['D'] = np.abs(df_s['累計頻率'] - df_s['理論分布'])
dmax = df_s['D'].max()
print("實際觀測D值為:%.4f" % dmax)
# D值序列計算結(jié)果表格
df_s['累計頻率'].plot(style = '--k.')
df_s['理論分布'].plot(style = '--r.')
plt.legend(loc = 'upper left')
plt.grid()
# 密度圖表示
df_s
下面是正態(tài)分布表和顯著性對照表
因為樣本數(shù)為35,大于30且小于50,所以p值在這個區(qū)間
另外的,由于D值為0.1597. 大于0.158,小于0.197,且樣本數(shù)量接近于30.所以我們可以認(rèn)為P值的取值區(qū)間在0.20 - 0.40
滿足p > 0.5的情況,所以服從正態(tài)分布。
直接用算法做KS檢驗
from scipy import stats
# scipy包是一個高級的科學(xué)計算庫,它和Numpy聯(lián)系很密切,Scipy一般都是操控Numpy數(shù)組來進行科學(xué)計算
data = [87,77,92,68,80,78,84,77,81,80,80,77,92,86,
76,80,81,75,77,72,81,72,84,86,80,68,77,87,
76,77,78,92,75,80,78]
# 樣本數(shù)據(jù),35位健康男性在未進食之前的血糖濃度
df = pd.DataFrame(data, columns =['value'])
u = df['value'].mean() # 計算均值
std = df['value'].std() # 計算標(biāo)準(zhǔn)差
stats.kstest(df['value'], 'norm', (u, std))
# .kstest方法:KS檢驗,參數(shù)分別是:待檢驗的數(shù)據(jù),檢驗方法(這里設(shè)置成norm正態(tài)分布),均值與標(biāo)準(zhǔn)差
# 結(jié)果返回兩個值:statistic → D值,pvalue → P值
# p值大于0.05,為正態(tài)分布
此時,pvalue > 0.05,不拒絕原假設(shè)。因此上面的數(shù)據(jù)服從正態(tài)分布。且一般情況下, stats.kstest(df[‘value’], ‘norm’, (u, std))一條語句就得到p值的結(jié)果。


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